2015年8月31日 (仮訳)広義のColletotrichum caudatumは種複合体である Crouch, JA., 2014. Colletotrichum caudatum s.l. is a species complex. IMA fungus. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4107893/ [Accessed August 30, 2015]. 【R3-02150】2015/08/31投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ 6種の草本由来のColletotrichum caudatumの21分離株について分子系統解析を行った。 その結果、広義の本種が単系統を形成し、4つのサブグループと3つの単系統からなる種複合体であることが明らかになった。 各系統が異なる宿主に対応することを示し、狭義のC. caudatumの記載文を修正するとともにC. alcorniiなど4種を新種記載した。 New York, USA (その他掲載種) Colletotrichum caudatum (Peck ex Sacc.) Peck ※本種のエピタイプ標本を指定した。 【よく似た種との区別】 Colletotrichum alcornii 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum baltimorense 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum somersetense 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum zoysiae 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなく日本に分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Caboolture (新種) Colletotrichum alcornii J. A. Crouch 語源…本種を初めて採集した菌学者、J. L. Alcorn氏に献名 【よく似た種との区別】 Colletotrichum caudatum 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する 本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum baltimorense 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する 本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum somersetense 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される 本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する 本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Colletotrichum zoysiae 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなく日本に分布する 本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される USA, Maryland, Baltimore County, Owings Mills, Natural Environment Area (新種) Colletotrichum baltimorense J. A. Crouch 語源…ボルチモア産の 【よく似た種との区別】 Colletotrichum caudatum 形態的に類似している 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum alcornii 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum somersetense 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum zoysiae 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなく日本に分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される USA, New Jersey, Somerset County, Somerset (新種) Colletotrichum somersetense J. A. Crouch 語源…サマセット産の 【よく似た種との区別】 Colletotrichum caudatum 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum alcornii 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum baltimorense 米国に分布する Sorghastrum nutansを宿主とする 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum zoysiae 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなく日本に分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される 山口県 (新種) Colletotrichum zoysiae J. A. Crouch 語源…シバ属の 【よく似た種との区別】 Colletotrichum caudatum 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり日本ではなく北米に分布する 本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum alcornii 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する 本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum baltimorense 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり日本ではなく北米に分布する 本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum somersetense 形態的に類似している Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる) 本種と異なり日本ではなく北米に分布する 本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される