2017年12月24日 (仮訳)Diaporthe属は側系統群である Gao, Y-H. et al., 2017. Diaporthe is paraphyletic. IMA fungus. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28824846 [Accessed December 24, 2017]. 【R3-04695】2017/12/24投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ Diaporthe属菌の分類を検討して8新種を記載し、Phomopsis属12種を本属に移した。 複数遺伝子に基づく分子系統解析により、本属が側系統群であることを明らかにした。 しかし、単系統群の複数属に分割するには時期尚早であり、さらなる標本とデータセットを要するとした。 中国雲南省Alni farm (新種) Diaporthe acutispora Y.H. Gao & L. Cai 語源…尖った胞子の 【よく似た種との区別】 Diaporthe xishuangbanica 中国に分布する 同じツバキ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 中国江西省 (新種) Diaporthe elaeagni-glabrae Y.H. Gao & L. Cai 語源…Elaeagnus glabraの 【よく似た種との区別】 Phomopsis arnoldiae 同じグミ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる β分生子の長さの範囲が重なる 本種より分生子柄のサイズが小さい 本種よりα分生子のサイズが小さい Phomopsis elaeagni 同じグミ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種より分生子柄の幅が狭い 本種よりα分生子が短い CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phomopsis elaeagnicola 同じグミ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子のサイズが小さい 本種よりβ分生子が長い 本種よりβ分生子の幅が狭い Diaporthe incompleta 中国に分布する 同じグミ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりチャノキを宿主とする 本種と異なりα分生子が知られていない 本種よりβ分生子が長い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州 (新種) Diaporthe incompleta Y.H. Gao & L. Cai 語源…不完全な(α分生子を欠くことから) 【よく似た種との区別】 Diaporthe elaeagni-glabrae 中国に分布する 同じグミ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりチャノキが宿主として知られていない 本種と異なりα分生子を形成する 本種よりβ分生子が短い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe velutina 中国に分布する 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりシロダモ属植物を宿主とする 本種と異なりグミ属植物が宿主として知られていない 本種と異なりα分生子が知られている 本種よりβ分生子が短い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 日本 (新種) Diaporthe podocarpi-macrophylli Y.H. Gao & L. Cai 語源…Podocarpus macrophyllusの 【よく似た種との区別】 Diaporthe pseudophoenicicola ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりPhoenix dactyliferaを宿主とする ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe cinerascens 同属の植物を宿主とする ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりFicus caricaを宿主とする 本種よりα分生子が長い 本種よりα分生子の幅が狭い 本種と異なりβ分生子を欠く ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phomopsis podocarpi 同じマキ属植物を宿主とする 本種よりα分生子が長い 本種よりα分生子の幅が狭い 本種と異なりβ分生子を欠く 中国・ラオス国境 (新種) Diaporthe undulata Y.H. Gao & L. Cai 語源…波打つ(コロニー縁部の形状から) 【よく似た種との区別】 Diaporthe biconispora CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりオレンジを宿主とする CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 中国江西省 (新種) Diaporthe velutina Y.H. Gao & L. Cai 語源…ビロード状の(コロニーの性状から) 【よく似た種との区別】 Diaporthe anacardii CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりAnacardium occidentaleを宿主とする CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe apiculata 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる 本種より分生子柄が短い 本種よりβ分生子が長い Diaporthe compacta 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる β分生子のサイズの範囲が重なる 本種より分生子柄が短い Diaporthe discoidispora 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる 本種よりβ分生子が長い Diaporthe eres 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる β分生子のサイズの範囲が重なる 本種より分生子柄が短い 本種よりα分生子の幅が広い Diaporthe oraccinii 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる β分生子のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子の幅が狭い Diaporthe penetriteum 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子が短い Diaporthe ueckerae 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる Diaporthe xishuangbanica 中国に分布する 同じツバキ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られていない 本種より分生子柄のサイズが大きい 本種よりα分生子の幅が広い 本種よりβ分生子の最大長が長い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe incompleta 中国に分布する 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりグミ属植物を宿主とする 本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られていない 本種と異なりα分生子が知られていない 本種よりβ分生子が長い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州 (新種) Diaporthe xishuangbanica Y.H. Gao & L. Cai 語源…シーサンパンナの 【よく似た種との区別】 Diaporthe velutina 中国に分布する 同じツバキ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られている 本種より分生子柄のサイズが小さい 本種よりα分生子の幅が狭い 本種よりβ分生子の最大長が短い ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe tectonigena 中国に分布する 同じチャノキを宿主とする ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりチークを宿主とする ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe acutispora 中国に分布する 同じツバキ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 分生子柄のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Diaporthe amygdali 同じツバキ属植物を宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる Diaporthe apiculata 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる Diaporthe compacta 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子が短い Diaporthe discoidispora 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる Diaporthe eres 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる α分生子のサイズの範囲が重なる Diaporthe foeniculacea 同じツバキ属植物を宿主とする 本種より分生子果のサイズが大きい 本種よりα分生子のサイズが小さい Diaporthe foeniculina 同じツバキ属植物を宿主とする α分生子のサイズの範囲が重なる 本種より分生子果のサイズが大きい Diaporthe hongkongensis 同じツバキ属植物を宿主とする 本種より分生子果のサイズが小さい 本種よりα分生子が短い Diaporthe oraccinii 同じチャノキを宿主とする 本種より分生子果のサイズが大きい 本種よりα分生子のサイズが小さい Diaporthe penetriteum 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子のサイズが小さい Diaporthe ueckerae 同じチャノキを宿主とする 分生子果のサイズの範囲が重なる 本種よりα分生子のサイズが小さい Phomopsis acaciicola 同じツバキ属植物を宿主とする 本種よりα分生子の幅が狭い Phomopsis theae 同じツバキ属植物を宿主とする 本種より分生子果のサイズが小さい 本種よりα分生子の幅が狭い 中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州 (新種) Diaporthe yunnanensis Y.H. Gao & L. Cai 語源…雲南産の 【よく似た種との区別】 Diaporthe siamensis CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりDasymaschalon属植物を宿主とする CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Diaporthe helianthi Munt.-Cvetk., Mihaljc. & M. Petrov (新組み合わせ) Diaporthe averrhoae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis averrhoae C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe camptothecae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis camptothecae C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe chimonanthi (C.Q. Chang, M.M. Xiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis chimonanthi C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe eucommiae (F.X. Chao & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis eucommiae F.X. Chao & P.K. Chi (新組み合わせ) Diaporthe eucommiicola (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis eucommiicola C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe glabrae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis glabrae C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe lagerstroemiae (C.Q. Chang, M.M. Xiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis lagerstroemiae C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe liquidambaris (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Udayanga & Castl. 旧名:Phomopsis liquidambaris C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe loropetali (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis loropetali C.Q. Chang (新組み合わせ、新学名) Diaporthe magnoliicola Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis magnoliae M.M. Xiang (新組み合わせ) Diaporthe michelina Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis micheliae C.Q. Chang (新組み合わせ) Diaporthe phyllanthicola (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai 旧名:Phomopsis phyllanthicola C.Q. Chang