2013年12月27日 (仮訳)Vascular wiltを起こすVerticillium属病原菌の系統分類および5新種の記載 Inderbitzin, P., Bostock, R. & Davis, R., 2011. Phylogenetics and taxonomy of the fungal vascular wilt pathogen Verticillium, with the descriptions of five new species. PloS one. Available at: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0028341 [Accessed December 27, 2013]. 【R3-00197】2013/12/27投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いたVerticillium属菌の分子系統解析を行った。 本属菌は菌糸に黄色色素を含むFlavexudansクレードと、含まないFlavnonexudansクレードの2クレードに大きく分けられた。 形態および培養性状の検討を行い、前者のクレードに含まれる3種、後者のクレードに含まれる2種をそれぞれ新種記載し、検索表を掲載した。 USA (新種) Verticillium alfalfae Inderb., H. W. Platt, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao 語源…アルファルファの 【よく似た種との区別】 Verticillium nonalfalfae 形態的には区別できないほど類似している ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりアルファルファに対して病原性を持たない 交配型が異なる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium albo-atrum 目立った独特の形質がない点で混同されやすい 分生子が褐色 分生子に1隔壁を生じる フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する PDA培地では小菌核を形成しない 系統的に遠縁 Verticillium dahliae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成しない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium longisporum ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成しない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される USA, California (新種) Verticillium isaacii Inderb., R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao 語源…Verticillium属の分類に貢献したIvor Isaac氏に献名 【よく似た種との区別】 Verticillium klebahnii 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりレタスに病原性を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium tricorpus 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりトマトに病原性を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium zaregamsianum 菌糸に黄色色素を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される USA, California (新種) Verticillium klebahnii Inderb., R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao 語源…Verticillium属の分類に貢献したHeinrich Klebahn氏に献名 【よく似た種との区別】 Verticillium isaacii 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium tricorpus 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりレタスではなくトマトに病原性を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium zaregamsianum 菌糸に黄色色素を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される 千葉県 (新種) Verticillium zaregamsianum Inderb., T. Usami, Takeshi Kanto, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao 語源…Rasoul Zare氏およびWalter Gams氏に献名 【よく似た種との区別】 Verticillium tricorpus 菌糸に黄色色素を含む ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium isaacii 菌糸に黄色色素を含む ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium klebahnii 菌糸に黄色色素を含む ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される 北海道 (新種) Verticillium nonalfalfae Inderb., H. W. Platt, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao 語源…アルファルファに発生しない 【よく似た種との区別】 Verticillium alfalfae 形態的には区別できないほど類似している ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりアルファルファに対して病原性を持つ 交配型が異なる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium albo-atrum 目立った独特の形質がない点で混同されやすい 分生子が褐色 分生子に1隔壁を生じる フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する PDA培地では小菌核を形成しない 系統的に遠縁 Verticillium dahliae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成しない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium longisporum ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成しない ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Verticillium albo-atrum Reinke & Berthold ※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、レクトタイプ(外部リンク)およびエピタイプ(PD747)を指定した。 【よく似た種との区別】 Verticillium alfalfae 目立った独特の形質がない点で混同されやすい 分生子が褐色 分生子に1隔壁を生じる フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する PDA培地では小菌核を形成しない 系統的に遠縁 Verticillium nonalfalfae 目立った独特の形質がない点で混同されやすい 分生子が褐色 分生子に1隔壁を生じる フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する PDA培地では小菌核を形成しない 系統的に遠縁 (その他掲載種) Verticillium dahliae Kleb. ※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、エピタイプを指定した(PD322)。 【よく似た種との区別】 Verticillium longisporum 本種より分生子のサイズが大きい Verticillium alfalfae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium nonalfalfae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Verticillium longisporum (C. Stark) Karapapa, Bainbr. & Heale 【よく似た種との区別】 Verticillium dahliae 本種より分生子のサイズが小さい Verticillium alfalfae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium nonalfalfae ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり休眠菌糸体を形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Verticillium nubilum Pethybr. ※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、レクトタイプ(外部リンク)およびエピタイプ(PD742)を指定した。 【よく似た種との区別】 Gibellulopsis nigrescens 形態的に類似しており、混同のおそれがある 本種より厚壁胞子のサイズが顕著に小さい (その他掲載種) Verticillium tricorpus I. Isaac ※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、アイソタイプと思われる菌株をレクトタイプ(外部リンク)として指定した。 【よく似た種との区別】 Verticillium isaacii 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium klebahnii 形態的には区別できないほど類似している 休眠菌糸体を形成する 小菌核を形成する 厚壁胞子を形成する 菌糸に黄色色素を持つ コロニーが黄色~橙色になる ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なりトマトではなくレタスに病原性を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される Verticillium zaregamsianum 菌糸に黄色色素を持つ ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁 本種と異なり厚壁胞子を多数形成する 本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する ACT、EF、GPD、TSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される