2014年2月22日 (仮訳)エキビョウキン属クレード8bの拡張:冬栽培の野菜と関係を持つ3新種 Bertier, L. & Brouwer, H., 2013. The expansion of Phytophthora clade 8b: three new species associated with winter grown vegetable crops. Persoonia. Available at: http://www.ingentaconnect.com/content/nhn/pimj/2013/00000031/00000001/art00003 [Accessed February 22, 2014]. 【R3-00417】2014/02/22投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ 過去数十年にわたって発見されてきた、エキビョウキン属クレード8bの種に類似する卵菌3種を、形態および分子のデータに基づき新種記載した。 これらの種は冬季の低温条件下でも生育が見られる耐冷菌で、各々が顕著な宿主特異性を持っていた。 さらに、「taxon castitis」および「taxon parsley」も未記載種の可能性があると考えられたが、新種記載を行うにはデータが不十分であった。 Netherlands (新種) Phytophthora cichorii Bertier, H. Brouwer, De Cock & D.E.L. Cooke 語源…キクニガナ属の 【よく似た種との区別】 Phytophthora dauci 造卵器の壁の厚さの範囲が重なる 卵胞子の幅の範囲が重なる 卵胞子の壁の厚さの範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C 生長速度の範囲が重なる(両方とも遅い) ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりチコリーではなくニンジンを宿主とする 本種より遊走子嚢の長軸が短い 本種より遊走子嚢の長軸/短軸比が小さい 本種より造精器のサイズが小さい 本種と異なり造精器が底着性ではなく側着性 本種より造卵器のサイズが小さい 本種と異なり厚壁胞子を形成する 本種と異なりヘテロタリックではなくホモタリック 最大生長温度が21°Cではなく24°C 最適生長温度が15-21°Cではなく9-18°C ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora lactucae 造卵器のサイズの範囲が重なる 卵胞子の幅の範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C 最大生長温度が24°C 最適生長温度が15-21°C ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりチコリーではなくレタスを宿主とする 本種より遊走子嚢の長軸が短い 本種より遊走子嚢の長軸/短軸比が小さい 本種より造精器のサイズが小さい 本種と異なり造精器が底着性ではなく主に側着性(底着性のものも稀にある) 本種より造卵器の壁が厚い 本種より卵胞子の壁が厚い傾向がある 本種と異なり厚壁胞子を形成する 本種と異なりヘテロタリックではなくホモタリック 本種より21°Cでの生長が速い傾向がある ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora porri ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりチコリーではなくリーキを宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora brassicae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 造精器が底着性 本種と異なりチコリーではなくキャベツを宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora primulae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりチコリーではなくサクラソウ属植物を宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される France (新種) Phytophthora dauci Bertier, H. Brouwer & De Cock 語源…ニンジン属の 【よく似た種との区別】 Phytophthora cichorii 造卵器の壁の厚さの範囲が重なる 卵胞子の幅の範囲が重なる 卵胞子の壁の厚さの範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C 生長速度の範囲が重なる(両方とも遅い) ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりニンジンではなくチコリーを宿主とする 本種より遊走子嚢の長軸が長い 本種より遊走子嚢の長軸/短軸比が大きい 本種より造精器のサイズが大きい 本種と異なり造精器が側着性ではなく底着性 本種より造卵器のサイズが大きい 本種と異なり厚壁胞子を形成しない 本種と異なりホモタリックではなくヘテロタリック 最大生長温度が24°Cではなく21°C 最適生長温度が9-18°Cではなく15-21°C ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora lactucae 遊走子嚢のサイズの範囲が重なる 遊走子嚢の長軸/短軸比の範囲が重なる 造精器が側着性 卵胞子の壁の厚さの範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 厚壁胞子のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C ホモタリックである ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりニンジンではなくレタスを宿主とする 本種より遊走子嚢の孔のサイズが大きい 本種より造精器の幅が狭い 本種と異なり稀に造精器が底着性になることがある 本種より造卵器のサイズが大きい 本種より造卵器の壁が厚い 本種より卵胞子の幅が広い 最大生長温度が21°Cではなく24°C 最適生長温度が9-18°Cではなく15-21°C 本種より21°Cでの生長が速い傾向がある Phytophthora brassicae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりニンジンではなくキャベツを宿主とする 本種と異なり造精器が側着性ではなく底着性 ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora porri ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりニンジンではなくリーキを宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora primulae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりニンジンではなくサクラソウ属植物を宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Greece, Marathon (新種) Phytophthora lactucae Bertier, H. Brouwer & De Cock 語源…アキノノゲシ属の 【よく似た種との区別】 Phytophthora cichorii 造卵器のサイズの範囲が重なる 卵胞子の幅の範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C 最大生長温度が24°C 最適生長温度が15-21°C ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりくレタスではなくチコリーを宿主とする 本種より遊走子嚢の長軸が長い 本種より遊走子嚢の長軸/短軸比が大きい 本種より造精器のサイズが大きい 本種と異なり造精器が主に側着性ではなく底着性(ただし、本種に底着性の造精器も稀に見られる) 本種より造卵器の壁が薄い 本種より卵胞子の壁が薄い傾向がある 本種と異なり厚壁胞子を形成しない 本種と異なりホモタリックではなくヘテロタリック 本種より21°Cでの生長が遅い傾向がある ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora dauci 遊走子嚢のサイズの範囲が重なる 遊走子嚢の長軸/短軸比の範囲が重なる 造精器が側着性 卵胞子の壁の厚さの範囲が重なる 菌糸膨大部のサイズの範囲が重なる 厚壁胞子のサイズの範囲が重なる 最小生長温度が0°C ホモタリックである ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりレタスではなくニンジンを宿主とする 本種より遊走子嚢の孔のサイズが小さい 本種より造精器の幅が広い 本種と異なり造精器が底着性になることがない 本種より造卵器のサイズが小さい 本種より造卵器の壁が薄い 本種より卵胞子の幅が狭い 最大生長温度が24°Cではなく21°C 最適生長温度が15-21°Cではなく9-18°C 本種より21°Cでの生長が遅い傾向がある Phytophthora brassicae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりレタスではなくキャベツを宿主とする 本種と異なり造精器が側着性ではなく底着性(ただし、本種に底着性の造精器も稀に見られる) ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora porri ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりレタスではなくリーキを宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Phytophthora primulae ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で近縁(同じクレード8bに含まれる) 本種と異なりレタスではなくサクラソウ属植物を宿主とする ITSおよびcox1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される ※このほか、「taxon castitis」および「taxon parsley」が本論文で検討されたが、データ不足のため、新種記載は見送られた(論文3行まとめには、新種記載論文の発表後反映予定)。