(仮訳)広義のColletotrichum caudatumは種複合体である
Crouch, JA., 2014. Colletotrichum caudatum s.l. is a species complex. IMA fungus. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4107893/ [Accessed August 30, 2015].
【R3-02150】2015/08/31投稿

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3行まとめ

6種の草本由来のColletotrichum caudatumの21分離株について分子系統解析を行った。
その結果、広義の本種が単系統を形成し、4つのサブグループと3つの単系統からなる種複合体であることが明らかになった。
各系統が異なる宿主に対応することを示し、狭義のC. caudatumの記載文を修正するとともにC. alcorniiなど4種を新種記載した。
New York, USA

(その他掲載種)

Colletotrichum caudatum (Peck ex Sacc.) Peck
※本種のエピタイプ標本を指定した。
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum alcornii
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum baltimorense
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum somersetense
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum zoysiae
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなく日本に分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Australia, Queensland, Caboolture

(新種)

Colletotrichum alcornii J. A. Crouch
語源…本種を初めて採集した菌学者、J. L. Alcorn氏に献名
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum caudatum
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する
本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum baltimorense
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する
本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum somersetense
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
本種と異なりオーストラリアではなく米国などに分布する
本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Colletotrichum zoysiae
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なりオーストラリアではなく日本に分布する
本種と異なりBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, Maryland, Baltimore County, Owings Mills, Natural Environment Area

(新種)

Colletotrichum baltimorense J. A. Crouch
語源…ボルチモア産の
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum caudatum
形態的に類似している
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum alcornii
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum somersetense
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum zoysiae
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなく日本に分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, New Jersey, Somerset County, Somerset

(新種)

Colletotrichum somersetense J. A. Crouch
語源…サマセット産の
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum caudatum
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum alcornii
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum baltimorense
米国に分布する
Sorghastrum nutansを宿主とする
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum zoysiae
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなく日本に分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくZoysia tenuifoliaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
山口県

(新種)

Colletotrichum zoysiae J. A. Crouch
語源…シバ属の
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum caudatum
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり日本ではなく北米に分布する
本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum alcornii
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり米国などではなくオーストラリアに分布する
本種と異なりSorghastrum nutansではなくBothriochloa bladhiiおよびImperata cylindricaを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum baltimorense
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり日本ではなく北米に分布する
本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum somersetense
形態的に類似している
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で近縁(同じC. caudatum種複合体に含まれる)
本種と異なり日本ではなく北米に分布する
本種と異なりZoysia tenuifoliaではなくSorghastrum nutansを宿主とする
Apn2+ITS+Mat1/Apn2+Sod2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される