(仮訳)Diaporthe属は側系統群である
Gao, Y-H. et al., 2017. Diaporthe is paraphyletic. IMA fungus. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28824846 [Accessed December 24, 2017].
【R3-04695】2017/12/24投稿

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3行まとめ

Diaporthe属菌の分類を検討して8新種を記載し、Phomopsis属12種を本属に移した。
複数遺伝子に基づく分子系統解析により、本属が側系統群であることを明らかにした。
しかし、単系統群の複数属に分割するには時期尚早であり、さらなる標本とデータセットを要するとした。
中国雲南省Alni farm

(新種)

Diaporthe acutispora Y.H. Gao & L. Cai
語源…尖った胞子の
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【よく似た種との区別】
Diaporthe xishuangbanica
中国に分布する
同じツバキ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
中国江西省

(新種)

Diaporthe elaeagni-glabrae Y.H. Gao & L. Cai
語源…Elaeagnus glabra
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【よく似た種との区別】
Phomopsis arnoldiae
同じグミ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
β分生子の長さの範囲が重なる
本種より分生子柄のサイズが小さい
本種よりα分生子のサイズが小さい
Phomopsis elaeagni
同じグミ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子柄の幅が狭い
本種よりα分生子が短い
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Phomopsis elaeagnicola
同じグミ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子のサイズが小さい
本種よりβ分生子が長い
本種よりβ分生子の幅が狭い
Diaporthe incompleta
中国に分布する
同じグミ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりチャノキを宿主とする
本種と異なりα分生子が知られていない
本種よりβ分生子が長い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州

(新種)

Diaporthe incompleta Y.H. Gao & L. Cai
語源…不完全な(α分生子を欠くことから)
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【よく似た種との区別】
Diaporthe elaeagni-glabrae
中国に分布する
同じグミ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりチャノキが宿主として知られていない
本種と異なりα分生子を形成する
本種よりβ分生子が短い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe velutina
中国に分布する
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりシロダモ属植物を宿主とする
本種と異なりグミ属植物が宿主として知られていない
本種と異なりα分生子が知られている
本種よりβ分生子が短い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
日本

(新種)

Diaporthe podocarpi-macrophylli Y.H. Gao & L. Cai
語源…Podocarpus macrophyllus
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【よく似た種との区別】
Diaporthe pseudophoenicicola
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりPhoenix dactyliferaを宿主とする
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe cinerascens
同属の植物を宿主とする
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりFicus caricaを宿主とする
本種よりα分生子が長い
本種よりα分生子の幅が狭い
本種と異なりβ分生子を欠く
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Phomopsis podocarpi
同じマキ属植物を宿主とする
本種よりα分生子が長い
本種よりα分生子の幅が狭い
本種と異なりβ分生子を欠く
中国・ラオス国境

(新種)

Diaporthe undulata Y.H. Gao & L. Cai
語源…波打つ(コロニー縁部の形状から)
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【よく似た種との区別】
Diaporthe biconispora
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオレンジを宿主とする
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
中国江西省

(新種)

Diaporthe velutina Y.H. Gao & L. Cai
語源…ビロード状の(コロニーの性状から)
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【よく似た種との区別】
Diaporthe anacardii
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりAnacardium occidentaleを宿主とする
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe apiculata
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
本種より分生子柄が短い
本種よりβ分生子が長い
Diaporthe compacta
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
β分生子のサイズの範囲が重なる
本種より分生子柄が短い
Diaporthe discoidispora
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
本種よりβ分生子が長い
Diaporthe eres
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
β分生子のサイズの範囲が重なる
本種より分生子柄が短い
本種よりα分生子の幅が広い
Diaporthe oraccinii
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
β分生子のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子の幅が狭い
Diaporthe penetriteum
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子が短い
Diaporthe ueckerae
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
Diaporthe xishuangbanica
中国に分布する
同じツバキ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られていない
本種より分生子柄のサイズが大きい
本種よりα分生子の幅が広い
本種よりβ分生子の最大長が長い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe incompleta
中国に分布する
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりグミ属植物を宿主とする
本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られていない
本種と異なりα分生子が知られていない
本種よりβ分生子が長い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州

(新種)

Diaporthe xishuangbanica Y.H. Gao & L. Cai
語源…シーサンパンナの
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【よく似た種との区別】
Diaporthe velutina
中国に分布する
同じツバキ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりシロダモ属植物が宿主として知られている
本種より分生子柄のサイズが小さい
本種よりα分生子の幅が狭い
本種よりβ分生子の最大長が短い
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe tectonigena
中国に分布する
同じチャノキを宿主とする
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりチークを宿主とする
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe acutispora
中国に分布する
同じツバキ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
分生子柄のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
ITS+nrLSU+TEF1およびCAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Diaporthe amygdali
同じツバキ属植物を宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
Diaporthe apiculata
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
Diaporthe compacta
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子が短い
Diaporthe discoidispora
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
Diaporthe eres
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
α分生子のサイズの範囲が重なる
Diaporthe foeniculacea
同じツバキ属植物を宿主とする
本種より分生子果のサイズが大きい
本種よりα分生子のサイズが小さい
Diaporthe foeniculina
同じツバキ属植物を宿主とする
α分生子のサイズの範囲が重なる
本種より分生子果のサイズが大きい
Diaporthe hongkongensis
同じツバキ属植物を宿主とする
本種より分生子果のサイズが小さい
本種よりα分生子が短い
Diaporthe oraccinii
同じチャノキを宿主とする
本種より分生子果のサイズが大きい
本種よりα分生子のサイズが小さい
Diaporthe penetriteum
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子のサイズが小さい
Diaporthe ueckerae
同じチャノキを宿主とする
分生子果のサイズの範囲が重なる
本種よりα分生子のサイズが小さい
Phomopsis acaciicola
同じツバキ属植物を宿主とする
本種よりα分生子の幅が狭い
Phomopsis theae
同じツバキ属植物を宿主とする
本種より分生子果のサイズが小さい
本種よりα分生子の幅が狭い
中国雲南省シーサンパンナ・タイ族自治州

(新種)

Diaporthe yunnanensis Y.H. Gao & L. Cai
語源…雲南産の
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【よく似た種との区別】
Diaporthe siamensis
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりDasymaschalon属植物を宿主とする
CAL+HIS+ITS+TEF1+TUBに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Diaporthe helianthi Munt.-Cvetk., Mihaljc. & M. Petrov
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(新組み合わせ)

Diaporthe averrhoae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis averrhoae C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe camptothecae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis camptothecae C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe chimonanthi (C.Q. Chang, M.M. Xiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis chimonanthi C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe eucommiae (F.X. Chao & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis eucommiae F.X. Chao & P.K. Chi
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(新組み合わせ)

Diaporthe eucommiicola (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis eucommiicola C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe glabrae (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis glabrae C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe lagerstroemiae (C.Q. Chang, M.M. Xiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis lagerstroemiae C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe liquidambaris (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Udayanga & Castl.
旧名:Phomopsis liquidambaris C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe loropetali (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis loropetali C.Q. Chang
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(新組み合わせ、新学名)

Diaporthe magnoliicola Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis magnoliae
M.M. Xiang
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(新組み合わせ)

Diaporthe michelina Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis micheliae C.Q. Chang
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(新組み合わせ)

Diaporthe phyllanthicola (C.Q. Chang, Z.D. Jiang & P.K. Chi) Y.H. Gao & L. Cai
旧名:Phomopsis phyllanthicola C.Q. Chang
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