2015年6月3日 (仮訳)DNAバーコーディングによるCladia aggregataグループの種同定 Parnmen, S. et al., 2013. Identification of species in the Cladia aggregata group using DNA barcoding (Ascomycota: Lecanorales). Phytotaxa. Available at: http://www.biotaxa.org/Phytotaxa/article/view/phytotaxa.115.1.1/0 [Accessed June 3, 2015]. 【R3-01886】2015/06/03投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ Cladia aggregata種複合体を対象として、DNAバーコーディングにおけるITS領域の有用性を検証した。 複数遺伝子の分子系統解析に基づき12種を想定した上で、ITS領域の種内変異と種間変異の比を評価したところ、当該領域を全種の識別に用いることができることが示された。 この結果に基づき、C. blanchoniiなど3新種を記載したほか、3新組み合わせを提唱した。 New Zealand, North Island, West Auckland, Mt. Albert (新種) Cladia blanchonii Parnmen & Lumbsch 語源…ニュージーランド人地衣学者でタイプ標本の採集者であるDan Blanchon氏に献名 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) 本種と異なりオーストラリアではなくタイ、マレーシアなどに分布する ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia cryptica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia gorgonea 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia neocaledonica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia tasmanica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia terebrata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) New Zealand, South Island, Southland, Mistletoe Lake, Te Anau Downs (新種) Cladia cryptica Parnmen & Lumbsch 語源…隠れた(隠蔽種であることから) 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる マレーシアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia blanchonii 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia gorgonea 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia neocaledonica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia tasmanica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia terebrata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアおよびニュージーランドに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Australia, Tasmania, Lake St. Clair National Park, Trail to Frenchman’s cap (新種) Cladia tasmanica Parnmen & Lumbsch 語源…タスマニアの 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) 本種と異なりオーストラリアではなくタイ、マレーシアなどに分布する ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia blanchonii 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia cryptica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia gorgonea 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia neocaledonica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia terebrata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) (新組み合わせ) Cladia gorgonea (Eschw.) Parnmen & Lumbsch 旧名:Cladonia gorgonea Eschweilerなど 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia blanchonii 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia cryptica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia neocaledonica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia tasmanica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia terebrata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) (新組み合わせ) Cladia neocaledonica (Räsänen) Parnmen & Lumbsch 旧名:Cladonia neocaledonica Räsänenなど 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia blanchonii 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia cryptica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia gorgonea 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia tasmanica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia terebrata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) (新組み合わせ) Cladia terebrata (Laurer) Parnmen & Lumbsch 旧名:Cenomyce terebrata Laurerなど 【よく似た種との区別】 Cladia aggregata(トゲシバリ) 同じCladia aggregata種複合体に含まれる 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia blanchonii 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia cryptica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia deformis 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia dumicola 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia gorgonea 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia inflata 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia neocaledonica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究) Cladia tasmanica 同じCladia aggregata種複合体に含まれる オーストラリアに分布する 複数遺伝子に基づく分子系統解析で近縁(先行研究) ITSバーコードで区別される 複数遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(先行研究)