2016年1月5日 (仮訳)Scheffersomyces属酵母クレードの複数遺伝子に基づく系統学的研究およびキシロースレダクターゼ遺伝子N末端領域の特性 Urbina, H. & Blackwell, M., 2012. Multilocus Phylogenetic Study of the Scheffersomyces Yeast Clade and Characterization of the N-Terminal Region of Xylose Reductase Gene. PLOS ONE. Available at: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0039128 [Accessed January 5, 2016]. 【R3-02533】2016/01/05投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ 植物組織および材生息性昆虫から分離されたキシロース発酵能を有する酵母を対象に分子系統解析を行った。 広葉樹から分離されたScheffersomyces quercinusなど3新種を記載し、Candida属7種に対して新組み合わせを提唱した。 キシロースレダクターゼ遺伝子N末端の保存された領域に発酵能に関連する可能性のある変異が含まれていること、XYL1およびRPB1遺伝子が迅速同定に使用できる可能性があることなどが示唆された。 Louisiana State University, Burden Research Plantation, Baton Rouge, East Baton Rouge Parish, Louisiana (新種) Scheffersomyces quercinus H. Urbina & M. Blackw. 語源…コナラ属の 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces virginianus 米国ルイジアナ州に分布する 同じコナラ属植物から分離される 37°Cで生育不能 0.1%シクロヘキシミド添加培地で生育可能 60%D-グルコース添加培地で生育可能 16%NaCl添加培地で生育不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりL-ラムノース、メリビオース、ラクトース、ラフィノース、メレジトース、myo-イノシトール、キナ酸、硝酸塩を資化可能 本種と異なりDL-乳酸、カダベリンを資化不能 本種と異なりビオチン+チアミン添加培地で生育可能 本種と異なりビオチン添加培地で生育不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される RAPD-PCRのバンドパターンで区別される Scheffersomyces insectosa nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces lignosus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりグルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces shehatae nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces stipitis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノースを資化可能 本種と異なりガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces illinoiensis 米国ルイジアナ州に分布する nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりコナラ属ではなくペカン属植物から分離される 本種と異なりラムノース、メリビオースを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Highland Rd. and S. Stadium Dr., Louisiana State University, Baton Rouge, East Baton Rouge Parish, Louisiana, USA (新種) Scheffersomyces virginianus H. Urbina & M. Blackw. 語源…Quercus virginianaの 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces quercinus 米国ルイジアナ州に分布する 同じコナラ属植物から分離される 37°Cで生育不能 0.1%シクロヘキシミド添加培地で生育可能 60%D-グルコース添加培地で生育可能 16%NaCl添加培地で生育不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりDL-乳酸、カダベリンを資化可能 本種と異なりL-ラムノース、メリビオース、ラクトース、ラフィノース、メレジトース、myo-イノシトール、キナ酸、硝酸塩を資化不能 本種と異なりビオチン添加培地で生育可能 本種と異なりビオチン+チアミン添加培地で生育不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される RAPD-PCRのバンドパターンで区別される Scheffersomyces insectosa nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりカダベリンを資化可能 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces lignosus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり乳酸、カダベリンを資化可能 本種と異なりラムノース、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces shehatae nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりカダベリンを資化可能 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces stipitis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり乳酸、カダベリンを資化可能 本種と異なりガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces illinoiensis 米国ルイジアナ州に分布する nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりコナラ属ではなくペカン属植物から分離される 本種と異なり乳酸、カダベリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される 810 Pecan Dr., St. Gabriel, Ascension Parish, Louisiana, USA (新種) Scheffersomyces illinoinensis H. Urbina & M. Blackw. 語源…ペカン (Carya illinoinensis) の 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces stipitis キシロース発酵能を有する nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1およびXYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される RAPD-PCRのバンドパターンで区別される Scheffersomyces insectosa nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces lignosus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces shehatae nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、メリビオースを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces stipitis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces virginianus 米国ルイジアナ州に分布する nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりペカン属ではなくコナラ属植物から分離される 本種と異なり乳酸、カダベリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces quercinus 米国ルイジアナ州に分布する nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりペカン属ではなくコナラ属植物から分離される 本種と異なりラムノース、メリビオースを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces coipomoensis (C. Ramírez & A.E. González) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida coipomoensis C. Ramírez & A.E. González (新組み合わせ) Scheffersomyces gosingicus (C.F. Lee) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida gosingica C.F. Lee 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces spartinae nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2に基づく分子系統解析で近縁 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces insectosa (Kurtzman) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida insectosa (Kurtzman) Kurtzman (基礎異名はCandida shehatae var. insectosa Kurtzman) 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces lignosus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸を資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1およびXYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される RAPD-PCRのバンドパターンで区別される Scheffersomyces quercinus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces virginianus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化可能 本種と異なりカダベリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces illinoiensis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces lignicola (Jindam., Limtong, Yongman., Tuntir., Potach., H. Kawas & Nakase) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida lignicola Jindam., Limtong, Yongman., Tuntir., Potach., H. Kawas & Nakase 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces queiroziae nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で近縁 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces lignosus (Kurtzman) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida lignosa (Kurtzman) Kurtzman (基礎異名はCandida shehatae var. lignosa Kurtzman) 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces insectosa nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸を資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1およびXYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される RAPD-PCRのバンドパターンで区別される Scheffersomyces quercinus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりグルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces virginianus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化可能 本種と異なり乳酸、カダベリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces illinoiensis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces queiroziae (R.O. Santos, R.M. Cadete, Badotti, A. Mouro, Wallheim, F.C.O. Gomes, Stambuk, Lachance & C.A. Rosa) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida queiroziae R.O. Santos, R.M. Cadete, Badotti, A. Mouro, Wallheim, F.C.O. Gomes, Stambuk, Lachance & C.A. Rosa 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces lignicola nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で近縁 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新組み合わせ) Scheffersomyces shehatae (H.R. Buckley & van Uden) H. Urbina & M. Blackw. 旧名:Candida shehatae H.R. Buckley & van Uden 【よく似た種との区別】 Scheffersomyces quercinus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、イヌリンを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces virginianus nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、ガラクチトール、乳酸、グルコサミン、トリプトファン、メリビオース、イヌリンを資化可能 本種と異なりカダベリンを資化不能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される Scheffersomyces illinoiensis nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、D1/D2、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりラムノース、メリビオースを資化可能 nrSSU+ITS+nrLSU+RPB1、XYL1遺伝子に基づく分子系統解析で明瞭に区別される