2015年3月24日 (仮訳)Cylindrocladiella属の系統分類 Lombard, L. et al., 2012. Phylogeny and taxonomy of the genus Cylindrocladiella. Mycological Progress. Available at: http://link.springer.com/article/10.1007/s11557-011-0799-1 [Accessed March 24, 2015]. 【R3-01671】2015/03/24投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ 20年間にわたって世界各地の様々な基質から得られたCylindrocladiella属菌の分離株を検討した。 形態学的検討および複数遺伝子に基づく分子系統解析を行い、5つの種複合体を認め、隠蔽種を含む18新種を記載した。 C. elegans種複合体など、分離株が不稔であるなどして分類が確定できなかった種複合体も残された。 Australia, Queensland, Daydream Island, Whitsundays Island Resort (新種) Cylindrocladiella australiensis L. Lombard & Crous 語源…オーストラリア産の 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella hawaiiensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなくハワイに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella pseudohawaiiensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなくブラジルおよびマダガスカルに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella infestans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が類輪生で二次分枝を形成するという特徴を欠く 本種と頂嚢の形状が異なる 本種より分生子のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Byron Bay (新種) Cylindrocladiella clavata L. Lombard & Crous 語源…棍棒形の(頂嚢の形状から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella variabilis オーストラリア、クイーンズランド州に分布する 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり頂嚢が棍棒形ではなく多様 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella lageniformis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 本種より分生子のサイズが僅かに小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella lanceolata オーストラリア、クイーンズランド州に分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Brisbane (新種) Cylindrocladiella cymbiformis L. Lombard & Crous 語源…舟形の(フィアライドの形状から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella elegans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella elegans種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の伸長部がずっと短い 本種と異なり分生子柄が類輪生 本種と異なりフィアライドが舟形ではなく樽形~腎臓形 本種より分生子のサイズが小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella novaezelandiae β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella elegans種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の伸長部がずっと短い 本種と異なりフィアライドが舟形ではなく樽形~腎臓形 本種より分生子のサイズが小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Lake Barrine (新種) Cylindrocladiella ellipsoidea L. Lombard & Crous 語源…楕円形の(頂嚢の形状から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が二次分枝を伴う類輪生でない 本種と異なり頂嚢が楕円形~棍棒形でない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella thailandica β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が二次分枝を伴う類輪生でない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Hawaii (新種) Cylindrocladiella hawaiiensis L. Lombard & Crous 語源…ハワイ産の 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり頂嚢が棍棒形でない 本種より分生子のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella australiensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりハワイではなくオーストラリアに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella pseudohawaiiensis 形態的に非常に類似しており区別が困難 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりハワイではなくブラジルおよびマダガスカルに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Kuranda (新種) Cylindrocladiella kurandica L. Lombard & Crous 語源…クランダ(オーストラリア、クイーンズランド州の地名)の 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に非常に類似しており、ほとんど区別できない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella pseudoinfestans β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella longistipitata 形態的に非常に類似しており、ほとんど区別できない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりオーストラリアではなく香港に分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Brisbane (新種) Cylindrocladiella lanceolata L. Lombard & Crous 語源…槍形の(頂嚢の形状から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella lageniformis 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり頂嚢が槍形でない 本種と分生子のサイズが異なる β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella clavata オーストラリア、クイーンズランド州に分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Thailand, Chiang Mai (新種) Cylindrocladiella longiphialidica L. Lombard & Crous 語源…長いフィアライドの 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella camelliae 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が類輪生でない 本種よりフィアライドが短い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella natalensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なりタイではなく南アフリカおよびオーストラリアに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella nederlandica 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なりタイではなくオランダに分布する 本種と異なり分生子柄が類輪生でない 本種よりフィアライドが短い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella pseudocamelliae タイ、チエンマイ県に分布する 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が類輪生でない 本種よりフィアライドが短い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される 中国香港 (新種) Cylindrocladiella longistipitata L. Lombard & Crous 語源…長い柄の(分生子柄の伸長部から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の伸長部が短い 本種と頂嚢の形状が異なる β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella thailandica 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり香港ではなくタイに分布する 本種より分生子柄の伸長部が短い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella kurandica 形態的に非常に類似しており、ほとんど区別できない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり香港ではなくオーストラリアに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される South Africa, KwaZulu-Natal (新種) Cylindrocladiella natalensis L. Lombard & Crous 語源…ナタール産の 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella elegans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella elegans種複合体に含まれる) 本種より分生子のサイズが小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella peruviana β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella longiphialidica β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なり南アフリカおよびオーストラリアではなくタイに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される The Netherlands (新種) Cylindrocladiella nederlandica L. Lombard & Crous 語源…オランダの 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella camelliae 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種よりフィアライドのサイズが小さい 本種と頂嚢の形状が僅かに異なる β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella longiphialidica 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なりオランダではなくタイに分布する 本種と異なり分生子柄が類輪生 本種よりフィアライドが長い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Thailand, Chiang Mai (新種) Cylindrocladiella pseudocamelliae L. Lombard & Crous 語源…偽のCylindrocladiella camelliae 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella camelliae 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の伸長部が短い 本種と異なり頂嚢が楕円形・瓶形・槍形でない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella longiphialidica タイ、チエンマイ県に分布する 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella camelliae種複合体に含まれる) 本種と異なり分生子柄が類輪生 本種よりフィアライドが長い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Brazil, São Paulo, Aracruz nursery (新種) Cylindrocladiella pseudohawaiiensis L. Lombard &Crous 語源…偽のCylindrocladiella hawaiiensis 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なり頂嚢が楕円形~棍棒形でない 本種より分生子のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella hawaiiensis 形態的に非常に類似しており区別が困難 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりブラジルおよびマダガスカルではなくハワイに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella australiensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりブラジルおよびマダガスカルではなくオーストラリアに分布する β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される The Netherlands, Apeldoorn, Paleis Het Loo (新種) Cylindrocladiella pseudoparva L. Lombard & Crous 語源…偽のCylindrocladiella parva 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella parva 形態的に非常に類似しており区別困難 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella parva種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の一次分枝のサイズが小さい 本種より分生子柄の二次分枝のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella stellenboschensis β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella parva種複合体に含まれる) 本種と異なりオランダではなく南アフリカ、カナダ、スイスに分布する 本種より分生子柄の一次分枝のサイズが小さい 本種より分生子柄の二次分枝のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland (新種) Cylindrocladiella queenslandica L. Lombard & Crous 語源…クイーンズランドの 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種より分生子のサイズが大きい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される South Africa, Western Cape Province, Stellenbosch, Stellenbosch Botanical Gardens (新種) Cylindrocladiella stellenboschensis L. Lombard &Crous 語源…ステレンボッシュ産の 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella parva 形態的に非常に類似しており区別困難 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella parva種複合体に含まれる) 本種と頂嚢の形状が異なる 本種と異なりフィアライドにカラレットを欠くか稀 本種より分生子のサイズが小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella pseudoparva β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella parva種複合体に含まれる) 本種と異なり南アフリカ、カナダ、スイスではなくオランダに分布する 本種より分生子柄の一次分枝のサイズが大きい 本種より分生子柄の二次分枝のサイズが小さい β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Thailand, Chiang Mai (新種) Cylindrocladiella thailandica L. Lombard & Crous 語源…タイの 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に非常に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種より分生子柄の伸長部が短い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella longistipitata 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) 本種と異なりタイではなく香港に分布する 本種より分生子柄の伸長部が長い β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, Queensland, Daydream island, Whitsundays Island Resort (新種) Cylindrocladiella variabilis L. Lombard & Crous 語源…変異の大きい(頂嚢の形状から) 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella lageniformis 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり類輪生の分生子柄を生じる 本種ほど頂嚢の形状が多様でない β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella clavata オーストラリア、クイーンズランド州に分布する 形態的に類似している β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり頂嚢が多様ではなく棍棒形 β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (新学名) Cylindrocladiella pseudoinfestans L. Lombard & Crous 旧名:Nectricladiella infestans Crous & C.L. Schoch 【よく似た種との区別】 Cylindrocladiella infestans 形態的に類似している(かつてテレオモルフ-アナモルフ関係にあると考えられていた) β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Cylindrocladiella kurandica β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で近縁(同じCylindrocladiella infestans種複合体に含まれる) β-チューブリン+ヒストンH3+ITSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される