(仮訳)西オーストラリアでのRubus anglocandicansの減少に関係する新種Phytophthora bilorbang
Aghighi, S. et al., 2012. Phytophthora bilorbang sp. nov., a new species associated with the decline of Rubus anglocandicans (European blackberry) in Western Australia. European journal of plant …. Available at: http://link.springer.com/article/10.1007/s10658-012-0006-5 [Accessed December 17, 2013].
【R3-00152】2013/12/17投稿

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3行まとめ

オーストラリアのRubus anglocandicans減少地域で、根および根圏土壌から分離された菌をPhytophthora bilorbangとして新種記載した。
本種は接種試験で萎凋や病斑の症状を起こし、コッホの原則が満たされたことから、本種がRubus anglocandicansの減少の原因である可能性が示唆された。
また、本種とほぼ同一の塩基配列が米国、英国、フランス、ポーランドなど世界各地で報告されていることから、本種が移入種である可能性も考えられた。
Western Australia, Pemberton, banks of Warren River

(新種)

Phytophthora bilorbang Aghighi & T. Burgess
語源…オーストラリア南東部のアボリジニ、ヌンガー族の言葉で「川の土手に住む人」
mycobank_logoSpecies_Fungorum

【よく似た種との区別】
Phytophthora gregata
西オーストラリア州に分布する
土壌から分離される
厚壁胞子を形成する
本種と同じくホモタリックである
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で本種と同じ「クレード6」に含まれる
胞子嚢が外部伸長を起こさない
胞子嚢柄が胞子嚢内部で部分的に分枝する
本種より寒天培地で盛んに凝集を形成し、直径170 μmに達する
PDA培地やV8A培地での生長が本種より速い
人参培地およびV8A培地で本種と異なり星形のコロニーを形成しない
最大生長温度が本種(30-32.5°C)より高い33-35°C
分離株の”abortion rate”が本種よりずっと高く、ほぼ100%に達することもある
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Phytophthora gibbosa
西オーストラリア州に分布する
土壌から分離される
厚壁胞子を形成する
本種と同じくホモタリックである
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で本種と同じ「クレード6」に含まれる
本種と異なり胞子嚢にやや乳頭突起を持つことがある
胞子嚢の内部伸長が決して”nested”タイプにならない
菌糸の膨大部が決して鎖状に連ならない
本種と異なり卵胞子の約半分に装飾が見られる
本種より卵胞子の壁が厚い
本種と異なり造精器が側着性ではなく底着性
寒天培地上で凝集を形成しない
PDA培地やV8A培地での生長が本種より速い
人参培地およびV8A培地で本種と異なり星形のコロニーを形成しない
最大生長温度が本種(30-32.5°C)より高い33-35°C
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Phytophthora megasperma
西オーストラリア州に分布する
土壌から分離される
厚壁胞子を形成する
本種と同じくホモタリックである
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で本種と同じ「クレード6」に含まれる
胞子嚢が外部伸長を起こさない
本種より胞子嚢のL/b比が小さい
菌糸膨大部のサイズが本種より大きい
寒天培地上で凝集を形成しない
PDA培地やV8A培地での生長が本種より速い
人参培地およびV8A培地で本種と異なり星形のコロニーを形成しない
ITS、HSP90、BT、coxI、NADHの各遺伝子領域を用いた分子系統解析で明瞭に区別される