(仮訳)Colletotrichum gigasporum種複合体
Liu, F. et al., 2014. The Colletotrichum gigasporum species complex. Persoonia. … Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4312939/ [Accessed January 11, 2016].
【R3-02552】2016/01/11投稿

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3行まとめ

複数遺伝子および単一遺伝子に基づく分子系統解析の結果、Colletotrichum gigasporum種複合体に7種を認めた。
そのうちC. arxiiC. magnisporumなど5種を新種記載した。
また、C. thailandicumC. gigasporumのシノニムとした。
Germany, Berlin

(新種)

Colletotrichum arxii F. Liu, L. Cai, Crous & Damm
語源…Josef Adolf von Arx氏に献名
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum macrosporum
同じラン科植物を宿主とする
本種と異なりドイツではなくブラジルなどに分布する
本種より分生子の幅が広い
Colletotrichum orchidearum
ドイツに分布する
本種より分生子が顕著に短い
Colletotrichum cinctum
同じPaphiopedilum属植物を宿主とする
本種と異なりドイツではなく米国などに分布する
本種と異なりOncidium属およびMaxillaria属植物が宿主として知られている
本種より分生子のサイズが顕著に小さい
Colletotrichum stanhopeae
同じラン科植物を宿主とする
本種と異なりドイツではなくブラジルなどに分布する
本種と異なりPaphiopedilum属ではなくStanhopea属植物などを宿主とする
本種より分生子のサイズが顕著に小さい
Colletotrichum vanillae
本種と異なりドイツではなくイタリアなどに分布する
本種と異なりPaphiopedilum属ではなくバニラ属植物などを宿主とする
本種より分生子のサイズが顕著に小さい
Colletotrichum lujae
本種と異なりドイツではなくベルギーなどに分布する
本種より分生子のサイズが顕著に小さい
Colletotrichum magnisporum
同じC. gigasporum種複合体に含まれる
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが大きい
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(計40塩基の差異)
本種と異なりGAPDH遺伝子に174bpの長い挿入配列を欠く

(新種)

Colletotrichum magnisporum F. Liu, L. Cai, Crous & Damm
語源…大きな胞子の
※本種のタイプ標本の採集地などは不明である。
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum arxii
同じC. gigasporum種複合体に含まれる
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが小さい
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される(計40塩基の差異)
本種と異なりGAPDH遺伝子に174bpの長い挿入配列を有する
Colletotrichum radicis
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが比較的小さい
本種と異なり分生子が直線状ではなく僅かに屈曲するものが多い
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
台湾

(新種)

Colletotrichum pseudomajus F. Liu, L. Cai, Crous & Damm
語源…偽のGlomerella major
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum camelliae
同じチャノキを宿主とする
本種と異なり台湾ではなくスリランカなどに分布する
本種より分生子のサイズが顕著に小さい
Glomerella cingulata f. camelliae
同じツバキ属植物を宿主とする
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より子嚢胞子のサイズがずっと小さい
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Glomerella major
同じチャノキを宿主とする
本種と異なり台湾ではなくインドなどに分布する
本種と異なり子嚢胞子がいくぶん尖った先端の三日月形ではなく先端が鈍頭~類尖形の楕円形
本種と異なり側糸を欠く
Costa Rica, La Selva

(新種)

Colletotrichum radicis F. Liu, L. Cai, Crous & Damm
語源…根の(宿主の根から分離されたことから)
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum magnisporum
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが比較的大きい
本種と異なり分生子が僅かに屈曲するものが多いのではなく直線状
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Vietnam, Lam Dong Province, Dalat

(新種)

Colletotrichum vietnamense F. Liu, L. Cai, Crous & Damm
語源…ベトナム産の
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum asianum
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum fructicola
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum kahawae
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum queenslandicum
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum siamense
本種と異なりC. gloeosporioides種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum acutatum
本種と異なりC. acutatum種複合体に含まれる
本種と異なりコーヒーノキ属ではなくパパイヤ属植物などを宿主とする
本種と異なりベトナムではなくオーストラリアなどに分布する
本種より分生子のサイズがずっと小さい
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Colletotrichum costaricense
本種と異なりC. acutatum種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum walleri
本種と異なりC. acutatum種複合体に含まれる
本種より分生子のサイズがずっと小さい
Colletotrichum coffeanum
同じコーヒーノキ属植物を宿主とする
本種と異なり分生子柄が無色~褐色ではなく無色
本種より分生子のサイズがずっと小さい
本種と異なり分生子が円筒形で末端が丸く、時に僅かに屈曲するのではなく長楕円形で末端が丸く、しばしば屈曲する
本種より剛毛が短い
本種と異なり剛毛の隔壁数が1-3または1-7ではなく1-2
Colletotrichum coffeophilum
同じコーヒーノキ属植物を宿主とする
分生子が無色
本種より分生子のサイズがずっと小さい
本種と異なり分生子が円筒形で末端が丸く、時に僅かに屈曲するのではなく楕円形
本種より剛毛が短い
本種と異なり剛毛に隔壁を欠く
Colletotrichum incarnatum
同じコーヒーノキ属植物を宿主とする
本種より分生子のサイズがずっと小さい
本種より剛毛が短い
本種と異なり剛毛が褐色~暗褐色ではなく暗褐色
Colletotrichum gigasporum
同じC. gigasporum種複合体に含まれる
ベトナムに分布する
同じコーヒーノキ属植物を宿主とする
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Colletotrichum gigasporum E.F. Rakotoniriana & F. Munaut
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【よく似た種との区別】
Colletotrichum taiwanense
子嚢胞子のサイズが類似している
本種と異なり子嚢胞子の隔壁数がほとんどの場合3で老成すると6-8隔壁までを有することがある
本種と異なり分生子の隔壁数が0-1ではなく成熟すると1-5隔壁を有することがある
Colletotrichum incarnatum
本種より分生子のサイズが小さい
Colletotrichum vietnamense
同じC. gigasporum種複合体に含まれる
ベトナムに分布する
同じコーヒーノキ属植物を宿主とする
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で近縁
ITSおよびACT+CHS-1+GAPDH+ITS+TUB2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される