(仮訳)市民科学プロジェクトにより明らかになったディディメラ科菌類の高度な多様性
Hou, L. et al. 2020. Citizen science project reveals high diversity in Didymellaceae (Pleosporales, Dothideomycetes). MycoKeys. Available at: https://mycokeys.pensoft.net/article/47704/ [Accessed September 1, 2024] 【R3-12028】2024/9/1投稿

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3行まとめ

市民科学プロジェクトとして、オランダの様々な地域で子供たちが庭で集めた土壌中の菌類を調査した。
分離された菌は形態学的検討および複数遺伝子に基づく分子系統解析により同定され、多くが既知の植物病原菌またはエンドファイトであった。
293サンプルのうち148サンプルがディディメラ科に属し、その中から1新属と12新種が見出された。
The Netherlands. Gelderland province, Wijchen

(新種)

Ascochyta benningiorum Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Eva Benning氏、Bas Benning氏、Anne Benning氏に献名
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【よく似た種との区別】
Ascochyta phacae
ヨーロッパに分布する
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなくスイスなどに分布する
本種と異なり土壌ではなくPhaca alpinaなどから分離される
本種より分生子のサイズが大きい
本種と異なり分生子の隔壁数が0ではなく0-1
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Limburg province, Weert

(新種)

Didymella degraaffiae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Janne de Graaff氏に献名
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【よく似た種との区別】
Didymella americana
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく米国などに分布する
本種と異なり土壌ではなくトウモロコシなどから分離される
本種より分生子形成細胞のサイズが小さい
本種より分生子のサイズが小さい
本種と異なり分生子の隔壁数が0ではなく時に1
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Didymella maydis
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく米国などに分布する
本種と異なり土壌ではなくトウモロコシなどから分離される
本種より分生子のサイズが大きい
本種と異なり分生子の隔壁数が0ではなく時に1
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Utrecht province, Vleuten

(新種)

Didymella kooimaniorum Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Noud & Robin Kooiman氏に献名
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The Netherlands. Ophemert

(新種)

Juxtiphoma kolkmaniorum Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Linde & Mette Kolkman氏に献名
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【よく似た種との区別】
Juxtiphoma eupyrena
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが僅かに小さい
本種と異なり分生子の油滴数が2より多いのではなく2
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Limburg province, Ell

(新種)

Nothophoma brennandiae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Kristel Brennand氏に献名
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【よく似た種との区別】
Nothophoma quercina
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく中国、ウクライナ、米国などに分布する
本種と異なり土壌ではなくPrunus avium、コナラ属の一種に発生したMicrosphaera alphitoides、ヒトの表皮組織などから分離される
本種と異なり分生子果表面が剛毛状ではなく無毛
本種と異なり分生子果あたりの孔口数が最大4ではなく1
本種より分生子のサイズが大きい
本種ほど分生子の油滴数が多くなく0–2(–3)
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Nothophoma pruni
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく中国などに分布する
本種と異なり土壌ではなくPrunus aviumなどから分離される
本種と異なり分生子が成熟すると褐色になるのではなく無色
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Gelderland province, Geldermalsen

(新種)

Paraboeremia rekkeri Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Daan Rekker氏に献名
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【よく似た種との区別】
Paraboeremia truiniorum
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻のサイズが小さい
本種より分生子殻の殻壁が厚い
本種と異なり分生子殻の殻壁が3-7層ではなく7-11層からなる
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Paraboeremia putaminum
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが小さい
本種と異なり分生子に帯緑色の油滴を含む
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Gelderland province, Barneveld, Voorthuizen

(新種)

Paraboeremia truiniorum Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Cuno & Tygo Truin氏に献名
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【よく似た種との区別】
Paraboeremia rekkeri
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻のサイズが大きい
本種より分生子殻の殻壁が薄い
本種と異なり分生子殻の殻壁が7-11層ではなく3-7層からなる
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Paraboeremia putaminum
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子のサイズが小さい
本種と異なり分生子に帯緑色の油滴を含む
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Gelderland province, Meteren

(新種)

Stagonosporopsis stuijvenbergii Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Simon van Stuijvenberg氏に献名
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【よく似た種との区別】
Stagonosporopsis weymaniae
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻の最大サイズが小さい
本種と異なり分生子殻が褐色ではなく類白色
本種と異なり小分生子を欠くのではなく有する
本種と異なり厚壁胞子を欠くのではなく有する
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Utrecht province, Baarn

(新種)

Stagonosporopsis weymaniae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Anna Weyman氏に献名
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【よく似た種との区別】
Stagonosporopsis stuijvenbergii
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻の最大サイズが小さい
本種と異なり分生子殻が類白色ではなく褐色
本種と異なり小分生子を有するのではなく欠く
本種と異なり厚壁胞子を有するのではなく欠く
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Stagonosporopsis bomiensis
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく中国などに分布する
本種と異なり庭園土壌ではなくムラサキ科植物などから分離される
本種と異なり植物病原菌として知られている
本種より分生子殻のサイズが小さい
本種と異なり小分生子が知られていない
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Stagonosporopsis papillata
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりオランダではなく中国などに分布する
本種と異なり庭園土壌ではなくRumex nepalensisなどから分離される
本種と異なり植物病原菌として知られている
本種より分生子殻のサイズが小さい
本種と異なり小分生子が知られていない
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. North Holland province, Amsterdam

(新種)

Vandijckomycella joseae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…(属名・種小名)José F.T.M. van Dijck氏に献名
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【よく似た種との区別】
Vandijckomycella snoekiae
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻のサイズが大きい
本種と異なり分生子殻の孔口が不明瞭である
本種と異なり分生子の油滴数が1-3ではなく2
本種より分生子の油滴のサイズが小さい
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Utrecht province, Utrecht

(新種)

Vandijckomycella snoekiae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Rana Marit Ida Snoek氏に献名
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【よく似た種との区別】
Vandijckomycella joseae
オランダに分布する
庭園土壌から分離される
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子殻のサイズが小さい
本種と異なり分生子殻の孔口が明瞭である
本種と異なり分生子の油滴数が2ではなく1-3
本種より分生子の油滴のサイズが大きい
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される
The Netherlands. Utrecht province, Baarn

(新種)

Xenodidymella weymaniae Hernández-Restrepo, L.W. Hou, L. Cai & P.W. Crous
語源…Anna Weyman氏に献名
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【よく似た種との区別】
Xenodidymella applanata
オランダに分布する
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりスウェーデンにおける分布が知られている
本種と異なり庭園土壌ではなくキイチゴ属植物などから分離される
本種より分生子殻のサイズが小さい
本種と異なり分生子殻が暗褐色ではなく淡褐色
本種と異なり分生子殻頸部が細長いのではなく僅かに乳頭状
本種と異なり分生子が長楕円形ではなく卵状
本種と異なり分生子の極に2つの油滴を含むのではなく数個の油滴を含む
本種と異なりOA培地でのコロニーがNaOH陰性ではなく淡い帯赤色を呈する
ITS+nrLSU+tub2+rpb2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(ヨーロッパ、オランダ新産種)

Paraboeremia litseae J.R. Jiang & L. Cai
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