2024年2月25日 (仮訳)Trichophyton benhamiae複合種における新興人獣共通感染菌の分類の解明 Čmoková, A. et al. 2020. Resolving the taxonomy of emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex. Fungal Diversity. Available at: https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-020-00465-3 [Accessed February 24, 2024] 【R3-11463】2024/2/25投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ 新興病原菌であるTrichophyton benhamiae複合種について4遺伝子座に基づく系統解析、集団遺伝学データ、表現型および生理学的解析、交配型遺伝子、生態データなどを使用して分類学的研究を実施した。 その結果、本複合体に9分類群を認め、そのうち3新種と1新変種を記載した。 本複合体の疫学的監視における強力なツールとして新規のマイクロサテライトタイピングスキームを提案した。 Switzerland, Lausanne, University Hospital Vaudois (新変種) Trichophyton benhamiae var. luteum Cmokova & Hubka 語源…黄色の(コロニーのリバースの色素から) 【よく似た種との区別】 Trichophyton benhamiae ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本変種と異なり主にヨーロッパではなく米国に分布する 本変種と異なり主にモルモットを宿主とするという特徴を欠く 本変種と異なりコロニーに黄色色素が沈着するという特徴を欠く 本変種と異なりコロニーの胞子形成が比較的乏しいという特徴を欠く 本変種と異なり大分生子を有する 本変種と異なりコロニーの生長が遅いという特徴を欠く 本変種と異なりクロラムフェニコール・シクロヘキシミド・MEA添加SAB培地で鮮やかな黄色色素を産生するという特徴を欠く 本変種とマイクロサテライトデータで識別できる 本変種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる Microsporum canis コロニーから鮮やかな黄色色素を産生する 本変種と異なり宿主が主にモルモットではなく主にネコとイヌである 本変種と異なり大分生子を有する 本変種よりコロニーの生長が速い Trichophyton concentricum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本変種と生態的に異なる 本変種と異なりコロニーから鮮やかな黄色色素を産生するという特徴を欠く 本変種と異なりコロニーが通常不稔である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton africanum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本変種より分生子柄の分枝が密でない ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Switzerland, Lausanne (新種) Trichophyton europaeum Cmokova & Hubka 語源…ヨーロッパの 【よく似た種との区別】 Trichophyton benhamiae リバースに赤褐色の色素を産生する 小分生子を豊富に形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と宿主スペクトルが異なる 本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が速い 本種と大分生子の形態が異なる ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton japonicum 形態的に類似している(識別困難な場合がある) MEA培地においてリバースが赤色または褐色に着色することがある 分生子柄が角錐状に分枝する 螺旋状菌糸の形成がかなり稀である コロニーの胞子形成が豊富である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種とマイクロサテライトデータで識別できる 本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton mentagrophytes 形態的に類似している(識別困難な場合がある) 本種と異なりコロニーが黄褐色~褐色に強く着色する 本種と異なりリバースが通常暗褐色である 本種と異なり螺旋状菌糸を豊富に形成する Trichophyton africanum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種ほど分生子柄の分枝が密でない ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Spain (新種) Trichophyton japonicum Cmokova & Hubka 語源…日本の 【よく似た種との区別】 Trichophyton europaeum 形態的に類似している(識別困難な場合がある) MEA培地においてリバースが赤色または褐色に着色することがある 分生子柄が角錐状に分枝する 螺旋状菌糸の形成がかなり稀である コロニーの胞子形成が豊富である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種とマイクロサテライトデータで識別できる 本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton africanum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種ほど分生子柄の分枝が密でない ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton benhamiae リバースに赤褐色の色素を産生する 小分生子を豊富に形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と宿主スペクトルが異なる 本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が速い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Mozambique (新種) Trichophyton africanum Cmokova & Hubka 語源…アフリカの 【よく似た種との区別】 Trichophyton erinacei 形態的に類似している(識別困難である可能性がある) ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりハリネズミに強く関連している 本種と異なり螺旋状菌糸を形成するという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton mentagrophytes 形態的に類似している 本種と異なりMEA培地におけるリバースが無色または淡色ではなく黄色または褐色である Trichophyton benhamiae var. luteum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種より分生子柄の分枝が密である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton europaeum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種より分生子柄の分枝が密である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton japonicum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種より分生子柄の分枝が密である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton benhamiae 分生子の長さが同一である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton bullosum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりコロニーの生長が非常に遅い 本種と異なりコロニーの胞子形成が乏しいかまたは欠く 本種と異なり厚壁胞子を豊富に形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton benhamiae (Ajello & S.L. Cheng) Y. Gräser & de Hoog 【よく似た種との区別】 Trichophyton europaeum リバースに赤褐色の色素を産生する 小分生子を豊富に形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と宿主スペクトルが異なる 本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が遅い 本種と大分生子の形態が異なる ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton japonicum リバースに赤褐色の色素を産生する 小分生子を豊富に形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と宿主スペクトルが異なる 本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が遅い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton mentagrophytes リバースに赤褐色の色素を産生する 小分生子を豊富に形成する Trichophyton concentricum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と生態的に大きく異なる 本種と異なりリバースが赤褐色でない 本種と異なりコロニーの生長が非常に遅い 本種と異なりコロニーが通常不稔である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton benhamiae var. luteum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり米国ではなく主にヨーロッパに分布する 本種と異なり主にモルモットを宿主とする 本種と異なりコロニーに黄色色素が沈着する 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的乏しい 本種と異なり大分生子を欠く 本種と異なりコロニーの生長が遅い 本種と異なりクロラムフェニコール・シクロヘキシミド・MEA添加SAB培地で鮮やかな黄色色素を産生する 本種とマイクロサテライトデータで識別できる 本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる Trichophyton africanum 分生子の長さが同一である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton concentricum R. Blanch. 【よく似た種との区別】 Trichophyton verrucosum 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と地理的分布が異なる 本種と宿主スペクトルが異なる 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である 本種よりコロニーの生長が速い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton bullosum 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と地理的分布が異なる 本種と宿主スペクトルが異なる 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である 本種よりコロニーの生長が速い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton schoenleinii 形態的に類似している 本種と地理的分布が異なる 本種と宿主スペクトルが異なる 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である 本種よりコロニーの生長が速い Trichophyton benhamiae ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と生態的に大きく異なる 本種と異なりリバースが赤褐色である 本種と異なりコロニーの生長が非常に遅いという特徴を欠く 本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton benhamiae var. luteum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と生態的に異なる 本種と異なりコロニーから鮮やかな黄色色素を産生する 本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton erinacei (J.M.B. Sm. & Marples) A.A. Padhye & J.W. Carmich. 【よく似た種との区別】 Trichophyton africanum 形態的に類似している(識別困難である可能性がある) ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりハリネズミに強く関連しているという特徴を欠く 本種と異なり螺旋状菌糸を形成する ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton mentagrophytes 形態的に類似している 本種と異なりリバースが淡色ではなく暗褐色 本種と異なり小分生子がほとんどの場合球形または類球形である 本種と異なり螺旋状菌糸を形成する Trichophyton eriotrephon ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種よりコロニーの生長が遅い 本種よりコロニーの胞子形成が比較的乏しい 本種と異なりコロニーから濃赤褐色の色素を産生する 本種と異なり小分生子の形状が様々である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton verrucosum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種よりコロニーの生長が遅い 本種と異なりコロニーが通常不稔である ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton eriotrephon Papegaay 【よく似た種との区別】 Trichophyton erinacei ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種よりコロニーの生長が速い 本種ほどコロニーの胞子形成が比較的乏しくない 本種と異なりコロニーから濃赤褐色の色素を産生するという特徴を欠く 本種と異なり小分生子の形状が様々であるという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton verrucosum E. Bodin 【よく似た種との区別】 Trichophyton bullosum 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton concentricum 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と地理的分布が異なる 本種と宿主スペクトルが異なる 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富であるという特徴を欠く 本種よりコロニーの生長が遅い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton erinacei ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種よりコロニーの生長が速い 本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Trichophyton bullosum Lebasque 【よく似た種との区別】 Trichophyton africanum ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なりコロニーの生長が非常に遅いという特徴を欠く 本種と異なりコロニーの胞子形成が乏しいかまたは欠くという特徴を欠く 本種と異なり厚壁胞子を豊富に形成するという特徴を欠く ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton eriotrephon 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Trichophyton concentricum 形態的に類似している ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁 本種と地理的分布が異なる 本種と宿主スペクトルが異なる 本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富であるという特徴を欠く 本種よりコロニーの生長が遅い ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される