(仮訳)AlternariaAlternaria節:種、分化型、それとも病原型?
Woudenberg, JHC. et al., 2015. Alternaria section Alternaria: Species, formae speciales or pathotypes? Studies in Mycology. Available at: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061615000123 [Accessed December 3, 2015].
【R3-02437】2015/12/04投稿

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3行まとめ

AlternariaAlternaria節の9種の形態種を対象に全ゲノム配列決定を行った。
さらに12種の形態種についてトランスクリプトームシーケンシングを、168分離株について複数遺伝子の配列決定を行い、SSU、LSU、ITSなど9遺伝子領域の識別能力を検証した。
これらの結果から本節に11種の系統学的種および1つの種複合体のみを認め、35形態種をA. alternataのシノニムとした。

(その他掲載種)

Alternaria alstroemeriae E.G. Simmons & C.F. Hill
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【よく似た種との区別】
Alternaria gaisen
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria alternata (Fr.) Keissl.
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(その他掲載種)

Alternaria betae-kenyensis E.G. Simmons
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【よく似た種との区別】
Alternaria eichhorniae
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria burnsii Uppal, Patel & Kamat
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【よく似た種との区別】
Alternaria tomato
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria eichhorniae Nag Raj & Ponnappa
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【よく似た種との区別】
Alternaria betae-kenyensis
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria gaisen Nagano ex Hara
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【よく似た種との区別】
Alternaria alstroemeriae
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria gossypina (Thüm.) J.C.F. Hopkins
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【よく似た種との区別】
Alternaria longipes
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria iridiaustralis E.G. Simmons
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(その他掲載種)

Alternaria jacinthicola Dagno & MH. Jijakli
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(その他掲載種)

Alternaria longipes (Ellis & Everh.) E.W. Mason
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【よく似た種との区別】
Alternaria gossypina
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria tomato (Cooke) L.R. Jones
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【よく似た種との区別】
Alternaria burnsii
同じAlternaria節に含まれる
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Alternaria arborescens E.G. Simmons
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(その他掲載種)

Alternaria cerealis E.G. Simmons & C.F. Hill
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(その他掲載種)

Alternaria geophila Dasz.
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(その他掲載種)

Alternaria senecionicola E.G. Simmons & C.F. Hill
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