2015年12月4日 (仮訳)Alternaria属Alternaria節:種、分化型、それとも病原型? Woudenberg, JHC. et al., 2015. Alternaria section Alternaria: Species, formae speciales or pathotypes? Studies in Mycology. Available at: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166061615000123 [Accessed December 3, 2015]. 【R3-02437】2015/12/04投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません(大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため)。 3行まとめ Alternaria属Alternaria節の9種の形態種を対象に全ゲノム配列決定を行った。 さらに12種の形態種についてトランスクリプトームシーケンシングを、168分離株について複数遺伝子の配列決定を行い、SSU、LSU、ITSなど9遺伝子領域の識別能力を検証した。 これらの結果から本節に11種の系統学的種および1つの種複合体のみを認め、35形態種をA. alternataのシノニムとした。 (その他掲載種) Alternaria alstroemeriae E.G. Simmons & C.F. Hill 【よく似た種との区別】 Alternaria gaisen 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria alternata (Fr.) Keissl. (その他掲載種) Alternaria betae-kenyensis E.G. Simmons 【よく似た種との区別】 Alternaria eichhorniae 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria burnsii Uppal, Patel & Kamat 【よく似た種との区別】 Alternaria tomato 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria eichhorniae Nag Raj & Ponnappa 【よく似た種との区別】 Alternaria betae-kenyensis 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria gaisen Nagano ex Hara 【よく似た種との区別】 Alternaria alstroemeriae 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria gossypina (Thüm.) J.C.F. Hopkins 【よく似た種との区別】 Alternaria longipes 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria iridiaustralis E.G. Simmons (その他掲載種) Alternaria jacinthicola Dagno & MH. Jijakli (その他掲載種) Alternaria longipes (Ellis & Everh.) E.W. Mason 【よく似た種との区別】 Alternaria gossypina 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria tomato (Cooke) L.R. Jones 【よく似た種との区別】 Alternaria burnsii 同じAlternaria節に含まれる ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で近縁 ITS+gapdh+EF1-α+rpb2+Alt a 1+endoPG+OPA10-2に基づく分子系統解析で明瞭に区別される (その他掲載種) Alternaria arborescens E.G. Simmons (その他掲載種) Alternaria cerealis E.G. Simmons & C.F. Hill (その他掲載種) Alternaria geophila Dasz. (その他掲載種) Alternaria senecionicola E.G. Simmons & C.F. Hill