(仮訳)ヒトおよび動物の感染症に関連するCladosporium属新種
Sandoval-Denis, M. et al., 2016. New species of Cladosporium associated with human and animal infections. Persoonia. Available at: http://www.repository.naturalis.nl/document/637024 [Accessed June 14, 2016].
【R3-03018】2016/06/15投稿

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3行まとめ

米国においてヒトおよび動物の臨床検体から分離されたCladosporium属菌を検討し、10新種を記載した。
そのうち6新種がC. cladosporioides種複合体に、3新種がC. herbarum種複合体に、1新種がC. sphaerospermum種複合体に、それぞれ属していた。
各種はそれぞれ同じ種複合体に含まれる近縁種とは分生子鎖や分生子の形態、培養性状などの表現型、および複数遺伝子に基づく分子系統解析により区別された。
USA, California

(新種)

Cladosporium alboflavescens Sandoval-Denis, Gené & Cano
語源…白色と黄色の(コロニーの色から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium pini­ponderosae
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくPinus ponderosaなどから分離される
本種より栄養生殖構造が濃色
本種と異なりOAおよびPDA培地でのコロニーが黄色~淡オリーブ色ではなく帯オリーブ灰色
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium verrucocladosporioides
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくRhus chinensisなどから分離される
本種より栄養生殖構造が濃色
本種と異なりOAおよびPDA培地でのコロニーが黄色~淡オリーブ色ではなく帯オリーブ灰色
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium iranicum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
顕微鏡的形質が類似している
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくCitrus sinensisの葉などから分離される
本種より分生子鎖がずっと長い
本種と異なり節間生の分生子が楕円形~円筒形ではなくしばしば類嘴状
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.8%、87.9%、90.1%)
USA, Texas

(新種)

Cladosporium angulosum Sandoval-Denis, Deanna A. Sutton & Guarro
語源…稜のある(分生子柄の形状から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium perangustum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
形態的に類似している(かつてこの種に同定されていた)
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁(ITS領域の塩基配列が同一)
本種と異なり臨床検体ではなく様々な植物から分離される
本種と異なり分生子が通常直角に分枝するのではなく時に分枝するのみである
本種より節間生の分生子のサイズが大きい
本種より枝状分生子のサイズが大きい
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度100%、77%、85.4%)
Cladosporium xantochromaticum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
米国に分布する
臨床検体、Acacia属植物などから分離される
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と分離源の植物種が異なる
本種より分生子柄の細胞が長い
本種より枝状分生子のサイズが小さい
本種と異なり35°Cで生育不能
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.1%、81.1%、90.8%)
USA, Minnesota

(新種)

Cladosporium anthropophilum Sandoval-Denis, Gené & Wiederhold
語源…ヒトを好む(ヒトの臨床検体から分離されたことから)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium cladosporioides
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
臨床検体から分離される
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり様々な植物や空中などから分離される
本種より分生子柄が短い
本種と異なり末端生の分生子が卵形~楕円形ではなく類球形~レモン形
本種と異なり分生子表面にSEMで微細な網目状装飾を認めるのではなく不規則な網目状または縞状
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium pseudocladosporioides
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくマツの針葉などから分離される
本種より分生子柄が短い
本種と異なり末端生の分生子が卵形~楕円形ではなく倒卵形~楕円形
本種と異なり分生子表面にSEMで微細な網目状装飾を認めるのではなく平滑~ほぼ平滑
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium tenuissimum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく様々な植物から分離される
本種と異なり日和見病原菌として知られている
本種より末端生の分生子が短い
本種より節間生の分生子が長い
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.3%、87.7%、89.9%)
USA, South Carolina

(新種)

Cladosporium crousii Sandoval-Denis, Cano & Guarro
語源…Pedro W. Crous氏に献名
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【よく似た種との区別】
Cladosporium gamsianum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子柄が短い
本種と異なり分生子柄が淡色ではなく暗褐色
本種と異なり分生子柄が厚壁
本種より末端生の分生子が短い
本種と異なり末端生の分生子が長楕円形ではなく倒卵形
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, Florida

(新種)

Cladosporium flavovirens Sandoval-Denis, Gené & Guarro
語源…黄緑色の(OA培地でのコロニーの色から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium flabelliforme
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくゴクラクチョウカ属植物などから分離される
本種より二次枝状分生子がやや短い
本種と異なり二次枝状分生子にしばしば隔壁を有するという特徴を欠く
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.8%、80.9%、81.8%)
USA, Minnesota

(新種)

Cladosporium floccosum Sandoval-Denis, Cano & Guarro
語源…羊毛状の(論文中の説明は「斑点状の小さな菌叢を生じる」)(コロニーの肉眼的形質から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium sinuosum
同じC. herbarum種複合体に含まれる
分生子柄が顕著な膝折状
枝状分生子を形成しない
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく様々な植物や空中などから分離される
本種より分生子柄のサイズがかなり大きい
本種と異なり分生子柄が稀にしか分枝しないという特徴を欠く
本種より末端生の分生子が僅かに長い
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, Montana

(新種)

Cladosporium subcinereum Sandoval-Denis, Deanna A. Sutton & Gené
語源…やや灰色の(コロニーの色から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium angustiherbarum
同じC. herbarum種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくPinus ponderosaなどから分離される
本種より分生子柄のサイズが小さい
本種と異なり枝状分生子を形成しない
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium variabile
同じC. herbarum種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり長い分生子鎖を形成する
本種と異なり臨床検体ではなくSpinacia oleraceaなどから分離される
本種と異なり節間生の分生子が類球形、倒卵形、楕円形ではなく広楕円形
本種と異なり分生子表面の装飾が顕著な小刺状、微突起状、水疱状ではなく微細な小粒状
本種と異なり枝状分生子に0-2隔壁ではなく多隔壁を有する
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium herbaroides
同じC. herbarum種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく塩水などから分離される
本種よりサイズが大きい分生子を形成する(二型のうちの一つ)
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Cladosporium herbarum
同じC. herbarum種複合体に含まれる
臨床検体から分離される
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子が長い
本種と異なり臨床検体ではなくオオムギなどから分離される
本種より分生子の幅が狭い
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, Florida

(新種)

Cladosporium succulentum Sandoval-Denis, Deanna A. Sutton & Cano
語源…液汁に満ちた(PDA培地で滲出物を豊富に生じることから)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium halotolerans
同じC. sphaerospermum種複合体に含まれる
枝状分生子の長さの範囲が重なる
臨床検体から分離される
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と枝状分生子の長さの範囲が異なる
本種と異なり塩水などから分離される
本種と異なり分生子の隔壁数が0-1ではなく最大5
本種と異なり最大生長温度が35°Cではなく30°C
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度98.4%、66.5%、79.8%)
Cladosporium sphaerospermum
同じC. sphaerospermum種複合体に含まれる
臨床検体から分離される
枝状分生子の長さの範囲が重なる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と枝状分生子の長さの範囲が異なる
本種と異なり分生子の隔壁数が0-1ではなく最大5
本種と異なり最大生長温度が35°Cではなく30°C
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度97.5%、72.7%、83.8%)
Cladosporium fusiforme
同じC. sphaerospermum種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく塩水などから分離される
本種と異なり末端生の分生子が卵形~短棍棒形ではなく倒卵形~紡錘形
本種と異なり枝状分生子を豊富に形成するという特徴を欠く
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.8%、80.7%、86.6%)
Cladosporium velox
同じC. sphaerospermum種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなくタケなどから分離される
本種と異なり末端生の分生子が卵形~短棍棒形ではなく球形~卵形
本種と異なり枝状分生子を豊富に形成するという特徴を欠く
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.8%、80.7%、86.6%)
USA, Florida

(新種)

Cladosporium tuberosum Sandoval-Denis, Cano & Wiederhold
語源…結節状の(分生子柄の形状から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium sinuosum
同じC. herbarum種複合体に含まれる
分生子鎖が短い
枝状分生子を形成しない
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく様々な植物や空中などから分離される
本種より分生子柄が膝折状
本種と異なり分生子が単生あるいは短い分生子鎖をなすのではなく常に分生子鎖を形成する
本種と異なりPDA培地でのコロニーがほぼ黒色ではなく淡オリーブ灰色~帯オリーブ灰色
本種よりPDA培地での生長が遅い
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
USA, Texas

(新種)

Cladosporium xantochromaticum Sandoval-Denis, Gené & Cano
語源…黄色の(PDA培地で産生する色素の色から)
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【よく似た種との区別】
Cladosporium angulosum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
米国に分布する
米国に分布する
臨床検体、Acacia属植物などから分離される
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と分離源の植物種が異なる
本種より分生子柄の細胞が短い
本種より枝状分生子のサイズが大きい
本種と異なり35°Cで生育可能
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.1%、81.1%、90.8%)
Cladosporium perangustum
同じC. cladosporioides種複合体に含まれる
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり臨床検体ではなく様々な植物から分離される
本種と異なり分生子柄表面が平滑ではなく粗面~小疣状で特に基部にかけていくぶん粗面、頂部が平滑~ほぼ平滑
本種より枝状分生子のサイズが大きい
ITS+EF1-α+actAに基づく分子系統解析で明瞭に区別される(類似度99.1%、75%、89.1%)