(仮訳)Vascular wiltを起こすVerticillium属病原菌の系統分類および5新種の記載
Inderbitzin, P., Bostock, R. & Davis, R., 2011. Phylogenetics and taxonomy of the fungal vascular wilt pathogen Verticillium, with the descriptions of five new species. PloS one. Available at: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0028341 [Accessed December 27, 2013].
【R3-00197】2013/12/27投稿

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3行まとめ

ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いたVerticillium属菌の分子系統解析を行った。
本属菌は菌糸に黄色色素を含むFlavexudansクレードと、含まないFlavnonexudansクレードの2クレードに大きく分けられた。
形態および培養性状の検討を行い、前者のクレードに含まれる3種、後者のクレードに含まれる2種をそれぞれ新種記載し、検索表を掲載した。
USA

(新種)

Verticillium alfalfae Inderb., H. W. Platt, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao
語源…アルファルファの
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【よく似た種との区別】
Verticillium nonalfalfae
形態的には区別できないほど類似している
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりアルファルファに対して病原性を持たない
交配型が異なる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium albo-atrum
目立った独特の形質がない点で混同されやすい
分生子が褐色
分生子に1隔壁を生じる
フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
PDA培地では小菌核を形成しない
系統的に遠縁
Verticillium dahliae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成しない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium longisporum
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成しない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
USA, California

(新種)

Verticillium isaacii Inderb., R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao
語源…Verticillium属の分類に貢献したIvor Isaac氏に献名
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【よく似た種との区別】
Verticillium klebahnii
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりレタスに病原性を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium tricorpus
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりトマトに病原性を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium zaregamsianum
菌糸に黄色色素を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
USA, California

(新種)

Verticillium klebahnii Inderb., R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao
語源…Verticillium属の分類に貢献したHeinrich Klebahn氏に献名
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【よく似た種との区別】
Verticillium isaacii
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium tricorpus
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりレタスではなくトマトに病原性を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium zaregamsianum
菌糸に黄色色素を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
千葉県

(新種)

Verticillium zaregamsianum Inderb., T. Usami, Takeshi Kanto, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao
語源…Rasoul Zare氏およびWalter Gams氏に献名
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【よく似た種との区別】
Verticillium tricorpus
菌糸に黄色色素を含む
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium isaacii
菌糸に黄色色素を含む
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium klebahnii
菌糸に黄色色素を含む
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する特徴が見られない
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する特徴が見られない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
北海道

(新種)

Verticillium nonalfalfae Inderb., H. W. Platt, R. M. Bostock, R. M. Davis & K. V. Subbarao
語源…アルファルファに発生しない
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【よく似た種との区別】
Verticillium alfalfae
形態的には区別できないほど類似している
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりアルファルファに対して病原性を持つ
交配型が異なる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium albo-atrum
目立った独特の形質がない点で混同されやすい
分生子が褐色
分生子に1隔壁を生じる
フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
PDA培地では小菌核を形成しない
系統的に遠縁
Verticillium dahliae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成しない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium longisporum
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成しない
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Verticillium albo-atrum Reinke & Berthold
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※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、レクトタイプ(外部リンク)およびエピタイプ(PD747)を指定した。

【よく似た種との区別】
Verticillium alfalfae
目立った独特の形質がない点で混同されやすい
分生子が褐色
分生子に1隔壁を生じる
フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
PDA培地では小菌核を形成しない
系統的に遠縁
Verticillium nonalfalfae
目立った独特の形質がない点で混同されやすい
分生子が褐色
分生子に1隔壁を生じる
フィアライドが発芽した分生子から直接生じることがあるが比較的稀
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
PDA培地では小菌核を形成しない
系統的に遠縁

(その他掲載種)

Verticillium dahliae Kleb.
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※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、エピタイプを指定した(PD322)。

【よく似た種との区別】
Verticillium longisporum
本種より分生子のサイズが大きい
Verticillium alfalfae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium nonalfalfae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Verticillium longisporum (C. Stark) Karapapa, Bainbr. & Heale
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【よく似た種との区別】
Verticillium dahliae
本種より分生子のサイズが小さい
Verticillium alfalfae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium nonalfalfae
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり休眠菌糸体を形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Verticillium nubilum Pethybr.
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※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、レクトタイプ(外部リンク)およびエピタイプ(PD742)を指定した。

【よく似た種との区別】
Gibellulopsis nigrescens
形態的に類似しており、混同のおそれがある
本種より厚壁胞子のサイズが顕著に小さい

(その他掲載種)

Verticillium tricorpus I. Isaac
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※本種のホロタイプは失われてしまっていたため、アイソタイプと思われる菌株をレクトタイプ(外部リンク)として指定した。

【よく似た種との区別】
Verticillium isaacii
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium klebahnii
形態的には区別できないほど類似している
休眠菌糸体を形成する
小菌核を形成する
厚壁胞子を形成する
菌糸に黄色色素を持つ
コロニーが黄色~橙色になる
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なりトマトではなくレタスに病原性を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される
Verticillium zaregamsianum
菌糸に黄色色素を持つ
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で近縁
本種と異なり厚壁胞子を多数形成する
本種と異なり休眠菌糸体を多数形成する
ACTEFGPDTSの4遺伝子を用いた分子系統解析で明瞭に区別される