(仮訳)Trichophyton benhamiae複合種における新興人獣共通感染菌の分類の解明
Čmoková, A. et al. 2020. Resolving the taxonomy of emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex. Fungal Diversity. Available at: https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-020-00465-3 [Accessed February 24, 2024] 【R3-11463】2024/2/25投稿

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3行まとめ

新興病原菌であるTrichophyton benhamiae複合種について4遺伝子座に基づく系統解析、集団遺伝学データ、表現型および生理学的解析、交配型遺伝子、生態データなどを使用して分類学的研究を実施した。
その結果、本複合体に9分類群を認め、そのうち3新種と1新変種を記載した。
本複合体の疫学的監視における強力なツールとして新規のマイクロサテライトタイピングスキームを提案した。
Switzerland, Lausanne, University Hospital Vaudois

(新変種)

Trichophyton benhamiae var. luteum Cmokova & Hubka
語源…黄色の(コロニーのリバースの色素から)
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【よく似た種との区別】
Trichophyton benhamiae
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本変種と異なり主にヨーロッパではなく米国に分布する
本変種と異なり主にモルモットを宿主とするという特徴を欠く
本変種と異なりコロニーに黄色色素が沈着するという特徴を欠く
本変種と異なりコロニーの胞子形成が比較的乏しいという特徴を欠く
本変種と異なり大分生子を有する
本変種と異なりコロニーの生長が遅いという特徴を欠く
本変種と異なりクロラムフェニコール・シクロヘキシミド・MEA添加SAB培地で鮮やかな黄色色素を産生するという特徴を欠く
本変種とマイクロサテライトデータで識別できる
本変種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる
Microsporum canis
コロニーから鮮やかな黄色色素を産生する
本変種と異なり宿主が主にモルモットではなく主にネコとイヌである
本変種と異なり大分生子を有する
本変種よりコロニーの生長が速い
Trichophyton concentricum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本変種と生態的に異なる
本変種と異なりコロニーから鮮やかな黄色色素を産生するという特徴を欠く
本変種と異なりコロニーが通常不稔である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton africanum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本変種より分生子柄の分枝が密でない
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Switzerland, Lausanne

(新種)

Trichophyton europaeum Cmokova & Hubka
語源…ヨーロッパの
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【よく似た種との区別】
Trichophyton benhamiae
リバースに赤褐色の色素を産生する
小分生子を豊富に形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と宿主スペクトルが異なる
本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が速い
本種と大分生子の形態が異なる
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton japonicum
形態的に類似している(識別困難な場合がある)
MEA培地においてリバースが赤色または褐色に着色することがある
分生子柄が角錐状に分枝する
螺旋状菌糸の形成がかなり稀である
コロニーの胞子形成が豊富である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種とマイクロサテライトデータで識別できる
本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton mentagrophytes
形態的に類似している(識別困難な場合がある)
本種と異なりコロニーが黄褐色~褐色に強く着色する
本種と異なりリバースが通常暗褐色である
本種と異なり螺旋状菌糸を豊富に形成する
Trichophyton africanum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種ほど分生子柄の分枝が密でない
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Spain

(新種)

Trichophyton japonicum Cmokova & Hubka
語源…日本の
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【よく似た種との区別】
Trichophyton europaeum
形態的に類似している(識別困難な場合がある)
MEA培地においてリバースが赤色または褐色に着色することがある
分生子柄が角錐状に分枝する
螺旋状菌糸の形成がかなり稀である
コロニーの胞子形成が豊富である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種とマイクロサテライトデータで識別できる
本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton africanum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種ほど分生子柄の分枝が密でない
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton benhamiae
リバースに赤褐色の色素を産生する
小分生子を豊富に形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と宿主スペクトルが異なる
本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が速い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Mozambique

(新種)

Trichophyton africanum Cmokova & Hubka
語源…アフリカの
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【よく似た種との区別】
Trichophyton erinacei
形態的に類似している(識別困難である可能性がある)
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりハリネズミに強く関連している
本種と異なり螺旋状菌糸を形成するという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton mentagrophytes
形態的に類似している
本種と異なりMEA培地におけるリバースが無色または淡色ではなく黄色または褐色である
Trichophyton benhamiae var. luteum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子柄の分枝が密である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton europaeum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子柄の分枝が密である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton japonicum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種より分生子柄の分枝が密である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton benhamiae
分生子の長さが同一である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton bullosum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりコロニーの生長が非常に遅い
本種と異なりコロニーの胞子形成が乏しいかまたは欠く
本種と異なり厚壁胞子を豊富に形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton benhamiae (Ajello & S.L. Cheng) Y. Gräser & de Hoog
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【よく似た種との区別】
Trichophyton europaeum
リバースに赤褐色の色素を産生する
小分生子を豊富に形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と宿主スペクトルが異なる
本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が遅い
本種と大分生子の形態が異なる
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton japonicum
リバースに赤褐色の色素を産生する
小分生子を豊富に形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と宿主スペクトルが異なる
本種よりMEAおよびPDA25°Cでの生長が遅い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton mentagrophytes
リバースに赤褐色の色素を産生する
小分生子を豊富に形成する
Trichophyton concentricum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と生態的に大きく異なる
本種と異なりリバースが赤褐色でない
本種と異なりコロニーの生長が非常に遅い
本種と異なりコロニーが通常不稔である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton benhamiae var. luteum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なり米国ではなく主にヨーロッパに分布する
本種と異なり主にモルモットを宿主とする
本種と異なりコロニーに黄色色素が沈着する
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的乏しい
本種と異なり大分生子を欠く
本種と異なりコロニーの生長が遅い
本種と異なりクロラムフェニコール・シクロヘキシミド・MEA添加SAB培地で鮮やかな黄色色素を産生する
本種とマイクロサテライトデータで識別できる
本種とMALDI-TOF MSスペクトルで識別できる
Trichophyton africanum
分生子の長さが同一である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton concentricum R. Blanch.
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【よく似た種との区別】
Trichophyton verrucosum
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と地理的分布が異なる
本種と宿主スペクトルが異なる
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である
本種よりコロニーの生長が速い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton bullosum
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と地理的分布が異なる
本種と宿主スペクトルが異なる
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である
本種よりコロニーの生長が速い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton schoenleinii
形態的に類似している
本種と地理的分布が異なる
本種と宿主スペクトルが異なる
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富である
本種よりコロニーの生長が速い
Trichophyton benhamiae
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と生態的に大きく異なる
本種と異なりリバースが赤褐色である
本種と異なりコロニーの生長が非常に遅いという特徴を欠く
本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton benhamiae var. luteum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と生態的に異なる
本種と異なりコロニーから鮮やかな黄色色素を産生する
本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton erinacei (J.M.B. Sm. & Marples) A.A. Padhye & J.W. Carmich.
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【よく似た種との区別】
Trichophyton africanum
形態的に類似している(識別困難である可能性がある)
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりハリネズミに強く関連しているという特徴を欠く
本種と異なり螺旋状菌糸を形成する
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton mentagrophytes
形態的に類似している
本種と異なりリバースが淡色ではなく暗褐色
本種と異なり小分生子がほとんどの場合球形または類球形である
本種と異なり螺旋状菌糸を形成する
Trichophyton eriotrephon
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種よりコロニーの生長が遅い
本種よりコロニーの胞子形成が比較的乏しい
本種と異なりコロニーから濃赤褐色の色素を産生する
本種と異なり小分生子の形状が様々である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton verrucosum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種よりコロニーの生長が遅い
本種と異なりコロニーが通常不稔である
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton eriotrephon Papegaay
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【よく似た種との区別】
Trichophyton erinacei
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種よりコロニーの生長が速い
本種ほどコロニーの胞子形成が比較的乏しくない
本種と異なりコロニーから濃赤褐色の色素を産生するという特徴を欠く
本種と異なり小分生子の形状が様々であるという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton verrucosum E. Bodin
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【よく似た種との区別】
Trichophyton bullosum
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton concentricum
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と地理的分布が異なる
本種と宿主スペクトルが異なる
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富であるという特徴を欠く
本種よりコロニーの生長が遅い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton erinacei
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種よりコロニーの生長が速い
本種と異なりコロニーが通常不稔であるという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される

(その他掲載種)

Trichophyton bullosum Lebasque
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【よく似た種との区別】
Trichophyton africanum
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と異なりコロニーの生長が非常に遅いという特徴を欠く
本種と異なりコロニーの胞子形成が乏しいかまたは欠くという特徴を欠く
本種と異なり厚壁胞子を豊富に形成するという特徴を欠く
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton eriotrephon
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される
Trichophyton concentricum
形態的に類似している
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で近縁
本種と地理的分布が異なる
本種と宿主スペクトルが異なる
本種と異なりコロニーの胞子形成が比較的豊富であるという特徴を欠く
本種よりコロニーの生長が遅い
ITS+gapdh+tef1α+tubbに基づく分子系統解析で明瞭に区別される