2015年1月17日 （仮訳）Colletotrichum orbiculare種複合体：農作物および雑草の重要な病原菌 Damm, U. et al., 2013. The Colletotrichum orbiculare species complex: Important pathogens of field crops and weeds. Fungal Diversity. Available at: http://link.springer.com/article/10.1007/s13225-013-0255-4 [Accessed January 17, 2015]. 【R3-01473】2015/01/17投稿 【お読みください】 大菌輪のコンテンツ「論文3行まとめ」は、あくまで論文の検索の補助として提供されている情報です。作成者は専門家ではなく、翻訳や内容の解釈が誤っている場合がありうるので、正確な情報は必ず元の論文で確認してください。また、このページのリンクは必ずしも有効ではありません（大菌輪未掲載の種や、MycoBank/Species fungorum未登録の種がありうるため）。 3行まとめ 炭疽病を起こすColletotrichum orbiculareおよび類縁種を対象に、形態学的検討および複数遺伝子に基づく分子系統解析を行った。 9クレードを認め、うち4クレードは既知種に該当したが、C. bidentisなど4種を新種記載した。 また、C. orbiculareが無効名であることを指摘し、同一の種小名で改めて新種記載した。 Brazil, Goiás, Jataí, road to Rio Verde, abandoned gas station （新種） Colletotrichum bidentis Damm, Guatimosim & Vieira 語源…センダングサ属の 【よく似た種との区別】 Colletotrichum gloeosporioides f. sp. pilosae 同じセンダングサ属植物を宿主とする 分生子のサイズの範囲が重なる 本種と異なりブラジルではなくインドに分布する 本種より分生子の幅が広い 本種より分生子のQ値が大きい Vermicularia bidentis 同じセンダングサ属植物を宿主とする 分生子のサイズの範囲が重なる 本種と異なり分生子が紡錘状 Colletotrichum dematium 同じセンダングサ属植物を宿主とする 本種と異なりブラジルではなくキューバ、ベネズエラ、西インド諸島に分布する Colletotrichum lindemuthianum 同じC. orbiculare種複合体に含まれる 形態的に類似している ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁 本種と異なり分生子が時に僅かに屈曲するという特徴を欠く 本種より剛毛の基部の幅が狭い 本種と異なり剛毛の先端が顕著に白色という特徴を欠く 本種と異なり剛毛の基部の細胞がしばしば淡褐色という特徴を欠く 本種よりコロニーの生長が速い ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される UK （その他掲載種） Colletotrichum malvarum (A. Braun & Casp.) Southw. ※本種のエピタイプを指定した。 【よく似た種との区別】 Colletotrichum magnusianum アオイ科植物を宿主とする 本種より分生子のサイズが大きい 本種と異なり円筒形ではなく僅かに屈曲した円筒形 本種より剛毛が短い Colletotrichum malvacearum アオイ科植物を宿主とする 本種と異なり分生子が直線状ではなく屈曲する Gloeosporium malvae ゼニアオイ属植物を宿主とする 本種より分生子のサイズが大きい 本種と異なり分生子が円筒形ではなく直線状または僅かに屈曲した類円筒形 Colletotrichum trifolii ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（ITSおよびCHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される UK （新種） Colletotrichum orbiculare Damm, P.F. Cannon & Crous 語源…円形の 【よく似た種との区別】 Glomerella magna 本種より分生子のサイズが大きい 本種より病原力が弱い 本種と塩基配列が異なる（C. orbiculare種複合体ではなく別の種複合体に含まれると見られる）本種とmtDNA RFLPの手法で区別される 本種とDNAフィンガープリンティングの手法で区別される Colletotrichum coccodes 本種より分生子が長い 本種より分生子の幅が広い Colletotrichum melonis 本種より分生子のQ値が大きい 本種と異なり分生子の少なくとも一端が尖る Vermicularia wallrothii 本種より分生子が長い 本種と異なり分生子が屈曲する Colletotrichum sidae ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1、GAPDH、TUB2の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum spinosum ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一、ITSの配列が同一のことがある） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum tebeestii ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される USA, Arkansas （新種） Colletotrichum sidae Damm & P.F. Cannon 語源…キンゴジカ属の 【よく似た種との区別】 Colletotrichum truncatum 米国に分布する 同じSida spinosaなどのキンゴジカ属植物を宿主とする 本種と異なりインドに分布する Colletotrichum orbiculare ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1、GAPDH、TUB2の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum spinosum ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum tebeestii ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1、HIS3、ACTの配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Australia, New South Wales, Coolah （新種） Colletotrichum spinosum Damm & P.F. Cannon 語源…刺状の/Xanthium spinosumの 【よく似た種との区別】 Colletotrichum acutatum 同じオナモミ属植物を宿主とする 本種と異なりオーストラリアおよびアルゼンチンではなくカナダに分布する 本種と異なりC. acutatum種複合体に含まれる 本種と異なり分生子が尖る Colletotrichum dematium 同じオナモミ属植物を宿主とする 異なる種複合体に含まれる Colletotrichum coccodes 同じオナモミ属植物を宿主とする 異なる種複合体に含まれる Colletotrichum truncatum 同じオナモミ属植物を宿主とする 異なる種複合体に含まれる Colletotrichum orbiculare ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1およびITSの配列が同一、ACTの差異が1塩基のみ） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum sidae ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum tebestii ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Canada, Saskatchewan, Raymore （新種） Colletotrichum tebeestii Damm & P.F. Cannon 語源…植物病理学者のDavid TeBeest氏に献名 【よく似た種との区別】 Colletotrichum orbiculare ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum sidae ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1、ACT、HIS3の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される Colletotrichum spinosum ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（CHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される （その他掲載種） Colletotrichum trifolii Bain, in Bain & Essary ※本種のレクトタイプおよびエピタイプ（採集地不明）を指定した。 【よく似た種との区別】 Colletotrichum destructivum 米国に分布する 同じシャジクソウ属植物を宿主とする 本種より分生子が長い 本種と異なり分生子が直線状ではなく直線状～僅かに屈曲する Gloeosporium trifolii 米国に分布する 同じシャジクソウ属植物を宿主とする 本種より分生子が長い Gloeosporium trifoliorum 同じシャジクソウ属植物を宿主とする 本種より分生子のサイズが小さい Colletotrichum medicaginis 同じウマゴヤシ属植物を宿主とする 本種と異なり分生子が両端が尖る三日月形 Colletotrichum malvarum ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で近縁（ITSおよびCHS-1の配列が同一） ITS+GAPDH+CHS-1+HIS3+ACT+TUB2+GSに基づく分子系統解析で明瞭に区別される